使用ggplot2更正堆叠区域图中的缺失值

我一直试图在堆积条形图/面积图的组合上重新创建此post。尽管如此，我仍然有一些缺失值的问题。使用ggplot2更正堆叠区域图中的缺失值

这里是我的数据：https://www.dropbox.com/sh/pnkspwnn1qslm6u/JapTKCwqMS

我跑什么;

wa=read.table('wa_class.txt', sep="", header=F, na.string="0") 
    names(wa)=c("Class","Jan","Feb","Mar","Apr","May","Jun","Jul","Aug","Sep","Oct","Nov","Dec") 
    wam=melt(wa) 
wam$variablen=as.numeric(wam$variable)

它的样子

> head(wam) 
        Class variable  value variablen 
1   Actinobacteria  Jan 38.115163   1 
2   Flavobacteria  Jan  NA   1 
3  Sphingobacteria  Jan 3.640469   1 
4 Alphaproteobacteria  Jan 13.631663   1 
5 Betaproteobacteria_b28  Jan 3.718671   1 
6  Betaproteobacteria  Jan 14.732354   1 

ggplot(na.omit(wam[,c("Class","value","variablen")]), aes(wam,x=variablen, y=value, fill=Class)) + geom_area(color="black") + geom_linerange(aes(ymax=value), position="stack") + scale_x_continuous(breaks=1:max(wam$variablen)) + labs(title="Water", x="Month", y="Relative abundance (%)")

...所以我试图纠正与使用na.omit的变量我情节缺失值。但是，我在图中获得了层，例如互相重叠（请参见保管箱文件夹）。

我发现这篇文章（见保管箱文件夹），它纠正了，但似乎只有一个。由于数据链接已经死亡，我无法复制它。

任何帮助真的很感谢！

谢谢，

乔

来源

2012-10-11 jO.

我不知道为什么你'Mar'在脚本开始。因此，这些数据与您在此发布的内容不完全相同。 –

哦，忘了在帖子中改变它。它当然应该从Jan开始，等等......现在纠正了。谢谢！ –

一种解决方案是读零为零值。如果你不使用na.string="0"，情节看起来就像这样：

enter image description here

来源

2012-10-12 08:41:42

谢谢！当然，为什么我没有想到...？：P –

使用ggplot2更正堆叠区域图中的缺失值

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