我想显示基于k-means的聚类算法的结果为pheatmap
。对于这一点,我在这里使用建议的程序:R draw kmeans clustering with heatmappheatmap集群注释
现在的问题是,我想补充一个配色方案,突出集群,类似“RowSideColors” -option东西heatmap
和heatmap.2
。至于pheatmap
,我发现只有annotation
选项,但这是工作在列而不是rowwise。有没有办法突出显示pheatmap
中的行簇?
我的另一个想法是将cluster-column作为单独的颜色添加到热图中。但是,我需要使用另一种配色方案而不是其他热图,因此我不确定是否可能。
你找到了一个解决方案?我正在寻找完全相同的东西! – 2014-06-19 14:48:52
@ Lilith-Elina不幸的是,我还没有找到解决方案。 – AnjaM 2014-06-20 06:31:46
太糟糕了。 :-(我不明白为什么pheatmap只注释列! – 2014-06-24 06:40:48