Python版本2.7：XML ElementTree：如何遍历子元素的某些元素以便找到匹配

Question

我是一名编程新手，很少使用Python，因此请耐心等待，因为我试图解释我是什么试图做:)

我有下面的XML：

<?xml version = "1.0" encoding = "utf-8"?> 
<Patients> 
    <Patient> 
       <PatientCharacteristics> 
        <patientCode>3</patientCode> 
       </PatientCharacteristics> 
       <Visits> 
        <Visit> 
          <DAS> 
           <CRP>14</CRP> 
           <ESR/> 
           <Joints> 
             <DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE> 
             <SWOL28>20</SWOL28> 
             <TEN28>20</TEN28> 
           </Joints> 
          </DAS> 
          <VisitDate>2010-02-17</VisitDate> 
        </Visit> 
        <Visit> 
          <DAS> 
           <CRP>10</CRP> 
           <ESR/> 
           <Joints> 
             <DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE> 
             <SWOL28>15</SWOL28> 
             <TEN28>20</TEN28> 
           </Joints> 
          </DAS> 
          <VisitDate>2010-02-10</VisitDate> 
        </Visit> 
       </Visits> 
    </Patient> 
    <Patient> 
     <PatientCharacteristics> 
        <patientCode>3</patientCode> 
     </PatientCharacteristics> 
       <Visits> 
        <Visit> 
          <DAS> 
           <CRP>14</CRP> 
           <ESR/> 
           <Joints> 
             <DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE> 
             <SWOL28>34</SWOL28> 
             <TEN28>0</TEN28> 
           </Joints> 
          </DAS> 
          <VisitDate>2010-08-17</VisitDate> 
        </Visit> 
        <Visit> 
          <DAS> 
           <CRP>10</CRP> 
           <ESR/> 
           <Joints> 
             <DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE> 
             <SWOL28></SWOL28> 
             <TEN28>2</TEN28> 
           </Joints> 
          </DAS> 
          <VisitDate>2010-07-10</VisitDate> 
        </Visit> 
        <Visit> 
          <DAS> 
           <CRP>9</CRP> 
           <ESR/> 
           <Joints> 
             <DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE> 
             <SWOL28>56</SWOL28> 
             <TEN28>6</TEN28> 
           </Joints> 
          </DAS> 
          <VisitDate>2009-07-10</VisitDate> 
        </Visit> 
       </Visits> 

    </Patient> 
</Patients> 

所有我想要做的，是更新某些“SWOL28的价值观是否匹配，我已经存储在一个文本文件中的patientCode和VisitDate 。据我所知，elementtree不包含父引用，就像它一样，我可以从根目录使用findall（）并从那里向后工作。因为它代表这是我的伪代码：

1. 在文本文件中的每一行：
2. 将VISIT_DATE Patient_Code New_SWOL28到变量
3. 对于每一个病人元素：
4. 如果patientCode = Patient_Code
5. 对于每个访问元素：
6. 如果VisitDate = Visit_Date
7. 如果此访问存在SWOL28元素
8. 更新SWOL28到New_SWOL28

但我被困在步数5.我如何获得访问列表来通过反复？道歉，如果这是一个非常愚蠢的问题，但我已经搜索了高和低的答案，我向你保证！我有我的代码精简到我需要低于固定部分的裸露例如：

import xml.etree.ElementTree as ET 
tree = ET.parse('DB3.xml') 
root = tree.getroot() 
for child in root: # THIS GETS ME ALL THE PATIENT ATTRIBUTES 
    print child.tag 
    for x in child/Visit: # THIS IS WHAT I CANNOT FIND THE CORRECT SYNTAX FOR 
     # I WOULD THEN PERFORM STEPS 6, 7 AND 8 HERE 

我会深深感激的任何想法，任何你可能会在这。我不是一个自然而然的编程！

由于提前， 萨拉

编辑1：

在SVK下面我建议尝试以下内容：

import xml.etree.ElementTree as ET 
tree = ET.parse('Untitled.xml') 
root = tree.getroot() 
for child in root: 
    print child.tag 
    child.find("visits") 
    for x in child.iter("visit"): 
     print x.tag, x.text 

但我得到的唯一输出是： 患者 患者 并且没有较低标记。有任何想法吗？

Answer 1

这是未经测试的通过它应该是相当接近你想要的文字。

for patient in root: 
    patient_code = patient.find('PatientCharacteristics').find('patientCode') 
    if patient_code.text == code: 
      for visit in patient.find('Visits'): 
        visit_date = visit.find('VisitDate') 
        if visit_date.text == date: 
         swol28 = visit.find('DAS').find('Joints').find('SWOL28') 
         if swol28.text: 
          visit.find('DAS').find('Joints').set('SWOL28', new_swol28) 

Answer 2

您可以直接下一个元素“元素”像这样在所有的“访问”标签迭代：

for x in element.iter("visit"): 

你可以找到一个特定的标签匹配与元素的第一直接子：

element.find("visits") 

看起来您首先必须找到“访问”的父级“访问”元素，然后遍历其“访问”子级。把这些在一起你有这样的事情：

for patient_element in root: 
    print patient_element.tag 
    visits_element = patient_element.find("visits") 
    for visit_element in visits_element.iter("visit"): 
     print visit_element.tag, visit_element.text 
     # ... further processing of each visit element here 

。在“寻找有趣的元素”为xml.etree文档中的部分一般看。ElementTree的：http://docs.python.org/2/library/xml.etree.elementtree.html#finding-interesting-elements

Answer 3

你可以使用一个CssSelector让你从病人的元素想要的节点：

from lxml.cssselect import CSSSelector 
visitSelector = CSSSelector('Visit') 
visits = visitSelector(child) 

你可以做同样得到patientCode标签和SWOL28标签 那么你就可以访问和modifiy元素的使用element.text

Answer 4

如果使用lxml.etree，您可以使用xpath找到你需要更新的元素。

E.g.

doc.xpath('Patient[PatientCharacteristics/patientCode=$patient]/Visits/Visit[VisitDate=$visit]',patient="3",visit="2009-07-10") 

所以

from lxml import etree 

doc = etree.parse("DB3.xml") 

changes = [ 
    dict(patient='3',visit='2010-08-17',swol28="99"), 
] 

def update_doc(x,d): 
    for row in d: 
    for visit in x.xpath('Patient[PatientCharacteristics/patientCode=$patient]/Visits/Visit[VisitDate=$visit]',**row): 
     for swol28 in visit.xpath('DAS/Joints/SWOL28'): 
     swol28.text = row['swol28'] 

update_doc(doc,changes) 

print etree.tostring(doc) 

应该产生你的东西，包含：

<Patient> 
    <PatientCharacteristics> 
    <patientCode>3</patientCode> 
    </PatientCharacteristics> 
    <Visits> 
    <Visit> 
     <DAS> 
     <CRP>14</CRP> 
     <ESR/> 
     <Joints> 
     <DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE> 
     <SWOL28>99</SWOL28> 
     <TEN28>0</TEN28> 
     </Joints> 
    </DAS> 
    <VisitDate>2010-08-17</VisitDate> 
    </Visit> 
    </Visits> 
</Patient>