python搜索和替换

我有一个文本字符串文件包含我想要替换的名称的文件。我有另一个文件有两列，A和B包含名称。列A包含与字符串（文件1）中相同的名称。我基本上想用B列中的名称来替换这些名称。我尝试过使用Python，但我仍然太过于习惯于将它拉下来。任何指针将不胜感激。python搜索和替换

 

File1    
NameA.....NameB....NameC....etc 

File2     
A  B  
NameA NameD   
NameB NameE   
NameC NameF

想;

 
File1      
NameD....NameE....NameF....etc

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2013-03-22 jO.

[你尝试过什么（http://www.whathaveyoutried.com）不工作 – AlG 2013-03-22 16:57:17

我应该补充说，当然是见 – 2013-03-23 14:03:42

我会考虑使用RegEx（Python中的re模块）。这将允许您创建可以搜索特定文本模式的函数。如果您正确地构造了re.compile（）函数和re.search（）函数，则可以使用group（）函数提取文本的选择“组”。该库是相当广泛的，所以这里是对文档的链接：

http://docs.python.org/2/library/re.html

我也想看看的在线教程，比如这一个：

http://www.youtube.com/watch?v=DRR9fOXkfRE

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2013-03-22 17:02:11 hillmandj

#read filrst file as list 
with open("file1") as f: 
    names1=f.read().strip().split(); 

#read file2 as dictionary 
with open("file2") as f: 
    names2=dict(i.strip().split() for i in f.readlines()) 

#write replacement in file3 
with open("file3","w") as f: 
    f.write(" ".join(names2[i] for i in names1))

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2013-03-22 17:10:12

我认为你需要这样的代码：

File1 = open("File1", "r") 
File2 = open("File2", "r") 
File3 = open("File3","w") 

for line in File2: 

    A, B = line.strip().split('\t') 

    for line_string in File1: 

     line_string.replace(A,B) 

     File3.write('%s\n' % line_string) 

File3.close()

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2013-03-22 17:38:28 Davit

with open('File1', 'r') as fd: 
    keys = fd.read().split() 

name_map = {} 

with open('File2', 'r') as fd: 
    for line in fd.readlines(): 
     key, value = line.split() 
     name_map[key] = value 

with open('File1', 'w') as fd: 
    new_names = [] 
    for k in keys: 
     new_names.append(name_map[k]) 
    fd.write(" ".join(new_names))

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2013-03-22 17:40:53 Yarkee

感谢您的回复。虽然没有一个确实没有正常工作。可能是由于file1中字符串的性质（newick格式）。这是我原来的工作......可能不太好。虽然，如果我能得到一个替代函数的工作，它可能会伎俩..？

import re 

LineString = open("file1.txt", "r").read() 

pattern = re.compile('\d+OTU\_\d+\_\w+\_\d+') 
words = pattern.findall(LineString) 

colA = [] 
colB = [] 

with open("file2.txt", "r") as f: 
for line in f: 
    parts = line.split() 
    if len(parts) > 0: 
     colA.append(parts[0]) 
    if len(parts) > 1: 
     colB.append(parts[1]) 

#Doesnt work 
if words == colA: 
LineString.replace(colA, colB)

字符串file1中一个看起来像：（（（（（（（（（（ '1OTU_1_769_wint_446'：0.00156420， '1OTU_1_822_wint_445'：0.00000000）0.5700：0.00156410， '1OTU_1_851_wint_454'：0.00000000）等...

话，可乐，COLB样子：？如1OTU_1_769_wint_446

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2013-03-23 13:43:49

将RegEx搜索与Yarkee提供的字典示例结合起来就像一个魅力一样。谢谢。 – 2013-03-23 14:56:15

您应该将它合并到您的阙中所有人都能看到它。 – AlG 2013-03-23 22:28:40

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