使用doMPI写入日志文件

Question

我在HPC上运行doMPI，我想记录来自工人的输出。使用doParallel，我可以使用makeCluster(outfile='myfile.log')。使用doMPI，在任何方法中似乎都不存在任何参数。我尝试使用sinkWorkerOutput()。这是有效的，但只为其中一名工作人员写了日志。我怀疑每个工人都在重写另一个工人。 outfile doMPI有模拟吗？

一个相关的问题 - 在一个工人内部，我能找到工人编号吗？

编辑：这是一个答案的链接讨论如何使用OUTFILE：在doMPI包How can I print when using %dopar%

感谢你的帮助，

本

Answer 1

为了工人的产量发送到一个文件，设置startMPIcluster “详细” 选项TRUE：

cl <- startMPIcluster(verbose=TRUE) 

这将创建一个文件p呃名字为“MPI_1_steve_41747.log”的工人。 MPI等级，用户名和进程ID用于使文件名唯一。您也可以通过“logdir”选项指定日志目录。

要获得工人编号，您可以简单地调用mpi.comm.rank函数。