使用r的数据处理

2013-04-06 76 views 1 likes

我有一个文件.ped谁包含多列，我想从中提取信息。这里我的数据的样本（没有标头）：使用r的数据处理

第一列表示的ID家族，第二个ID的个体，个体的第三性别。

我读表作为数据帧

ped <- read.table("pedigree.ped", header=FALSE)

我如何计算家庭的数量存在（一个家庭可以出现一个以上的时间，我要考虑他们作为一个）？我有一个性别专栏，其中1个指定男性和2个女性，我如何获得数据集中男性和女性的分布？

我是R新手，如果你可以给一些代码！

谢谢先进。

2013-04-06 Hocine Ben

请发送您的数据样本。 – 2013-04-06 01:48:27

^^^ this - 'head（ped）' – Nishanth 2013-04-06 01:50:12

请给我指数 – 2013-04-06 02:14:51

回答

既然你是R的新手，我会建议先看看excel。你所要求的操作相当简单，可以在Excel中完成。

如果要使用，则成为考虑data.frame索引，子集等

如果您熟悉SQL，来看一下，sqldf package

多的家庭：

numFamilies <- length(unique(ped[,1]))

男性数量&女性：

numMales <- sum(ped[,3] == 1) 
numFemales <- sum(ped[,3] == 2)

2013-04-06 01:49:18 Nishanth

SQL和R的关系是什么？ – 2013-04-06 01:54:49

很多R语法新手都熟悉sql界面。 select，count，groupby等。您可以使用sqldf包查询data.frame对象。 – Nishanth 2013-04-06 01:59:44

@ e4e5f4：不一定。 – Metrics 2013-04-06 02:01:04

请尝试使用此功能浏览数据：

For family: 
table(ped[,1]) 

For sex: 
table(ped[,3])

2013-04-06 02:14:45 Metrics