命令从Shell脚本工作，但不是从命令行？

Question

我在发帖之前很快搜索到了这个，但是找不到任何类似的帖子。让我知道他们是否存在。

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正在执行的命令看起来很简单。目录列表被用作函数的输入。

该目录包含了一堆命名文件的

命令行版本（这是执行时的bash运行） “epi1_mcf_0 ### nii.gz”：

fslmerge -t output_file `ls epi1_mcf_0*.nii.gz` 

shell脚本版本：

#!/bin/bash 
fslmerge -t output_file `ls epi1_mcf_0*.nii.gz` 

命令行版本失败，但shell脚本完美工作。

该错误消息是特定于该功能的，但无论如何它都包含在内。

** ERROR (nifti_image_read): failed to find header file for 'epi1_mcf_0000.nii.gz' 
** ERROR: nifti_image_open(epi1_mcf_0000.nii.gz): bad header info 
Error: failed to open file epi1_mcf_0000.nii.gz 
Cannot open volume epi1_mcf_0000.nii.gz for reading! 

我一直非常沮丧与这个问题（更少，因为我知道有一种方法来获得命令的工作）。

任何帮助，将不胜感激。

（或者说是普遍的共识，这个问题应该在“fslmerge”功能来寻找？）

Answer 1

（我第一次提到这个的评论，但我会做出一个答案，因为它帮助！）

你有任何的shell别名定义？ （类型alias）这些会影响命令行键入的命令，但不会影响脚本。

Linux通常有ls定义为ls --color。这可能会影响输出，因为颜色代码是通过常规输出流作为转义代码发送的。如果您使用ls --color=auto，它将自动检测其输出是否为终端。从man ls：

默认情况下，颜色不用于区分文件的类型。这是 相当于使用--color=none。使用--color选项，而不使用 可选WHEN参数等同于使用--color=always。通过 --color=auto，仅当标准输出连接到终端（tty）时才输出颜色代码。

Answer 2

`ls epi1_mcf_0*.nii.gz`更好写成简单epi1_mcf_0*.nii.gz。如：

fslmerge -t output_file epi1_mcf_0*.nii.gz 

该`ls`不添加任何东西。

^{注意：发布为答案而不是评论。 Markdown-lite注释解析器在我的`` `ls epi1_mcf_0*.nii.gz` ``标记上ch咽。}