2012-04-14 124 views
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我想将公式的右侧传递给R函数,然后“公式”的左侧添加并调用gam()。我想实现这个没有丑as.formula()结构等如何将公式的右侧传递给另一个公式?

我陷入了下面的最小的例子,你知道什么地方出了问题吗?

require(mgcv) 
set.seed(0) ## set.seed(1) 
gamEx1 <- gamSim(1, n=400, dist="normal", scale=2) ## simulate some data 
str(gamEx1) ## display structure 

## calling gam() and passing the right-hand side of a formula 
gamFitter <- function(formula.RHS, data, ...){ 
    z <- 2*data$y + data$f0 # some given values 
    gam(z ~ formula.RHS, data=data, ...) # call gam() 
} 

## call the function with the right-hand side of a formula 
gamFitter(formula.RHS=~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3), data=gamEx1) 

Error in model.frame.default(formula = z ~ formula.RHS, data = data, 
          drop.unused.levels = TRUE) : 
    invalid type (language) for variable 'formula.RHS' 

回答

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似乎您应该使用R,na的内置功能的mely update.formula,没有必要写一个新的功能:

> form <- ~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3) 
> form 
~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3) 
> update.formula(form, z ~ .) 
z ~ s(x0) + s(x1) + s(x2) + s(x3) 
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谢谢,德里克,我不知道这个函数存在。 – 2012-05-04 04:48:31

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@MariusHofert在我看来,这个答案比目前接受的更优雅。你能重新考虑接受吗? – Andrie 2013-08-05 13:26:02

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缺憾,但它的工作原理:

form1 <- as.formula("hi ~ lo + mid") 
form2 <- as.formula("blue ~ red + green") 
form2[[3]] <- form1[[3]] 
> form2 
blue ~ lo + mid 
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嗯,因为我写的,我*不*希望使用'as.formula()'和字符串,这只是不好的做法。不管怎么说,还是要谢谢你。 – 2012-04-14 15:39:22

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@MariusHofert - 你能解释一下关于'as.formula()'的坏习惯吗? – Chase 2012-04-14 16:45:25

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公式是一个公式 - 应该这样对待。将它转换为/通过字符串处理它是不好的做法。请注意,建议使用公式构建函数的方法在此处处理:http://developer.r-project.org/model-fitting-functions.txt两个很好的例子,它们不*涉及字符串(因此不需要'as.formula()')是'lm()'和'(mgcv::) gam'的函数。 – 2012-04-14 16:52:59

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这里是在@ GSK3的想法版本建设:

changeLHS <- function(formula, lhs) { 
    if (length(formula) == 2) { 
    formula[[3]] <- formula[[2]] 
    } 
    formula[[2]] <- substitute(lhs) 
    formula 
} 

changeLHS(a~b+c, z+w) # z + w ~ b + c 
changeLHS(~b+c, z+w) # z + w ~ b + c 

所以,你的代码就变成了:

gamFitter <- function(formula.RHS, data, ...){ 
    frm <- changeLHS(formula.RHS, 2*y + f0) 
    gam(frm, data=data, ...) # call gam() 
} 
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*不错*,谢谢。我想'rhs'应该在'changeLHS'中用'lhs'来表示更清楚,但是它确实很好。 – 2012-04-14 21:42:51

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@MariusHofert - 好点,我改变了。现在“右侧”是左边的,对吧? ;-) – Tommy 2012-04-14 21:46:17

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建立在其他的答案,如果你需要更换LHS programmatically by passing strings(点菜reformulate),然后两个小调整可以提供帮助。

使用@汤的做法:

changeLHS <- function(formula, lhs) { 
    if (length(formula) == 2) { 
     formula[[3]] <- formula[[2]] 
    } 
    formula[[2]] <- as.symbol(lhs) 
    formula 
} 

form <- ~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3) 
changeLHS(form, "z") 
## z ~ s(x0) + s(x1) + s(x2) + s(x3) 

使用@德里克的做法:

update(form, reformulate(".", "z")) 
## z ~ s(x0) + s(x1) + s(x2) + s(x3) 
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