有没有办法链接snakemake规则没有触摸文件？

有没有办法完成下面的帮助所有规则，而不会创建不需要的空文件helpA，helpB，helpC，然后删除它们？有没有办法链接snakemake规则没有触摸文件？

rule helpA: 
    output: touch("helpA") 
    shell: "echo 'help on subject <A>'" 

rule helpB: 
    output: touch("helpB") 
    shell: "echo 'help on subject <B>'" 

rule helpC: 
    output: touch("helpC") 
    shell: "echo 'help on subject <C>'" 

rule helpAll: 
    input: "helpA","helpB","helpC" 
    shell: "rm {input}

一个很好的解决方案将是以下排序的规则的依赖，但这不是有效snakecode：

rule helpAll: 
    input: rules.helpA,rules.helpB,rules.helpC

或：

rule helpAll: 
    depends_on_rule: helpA,helpB,helpC

来源

2017-08-10 tedtoal

我不认为snakemake会在磁盘上创建文件时正常工作。

但是您可以使用temp以便文件自动删除。更具体地，从文档：

Snakemake允许输出文件标记为暂时的，使得它们删除一次耗时的工作已经执行。

reference

来源

2017-08-12 12:08:27

你甚至可以将它们组合起来：'温度（触摸（ “文件”））'。 –

这听起来像解决方案！谢谢。 – tedtoal

有没有办法链接snakemake规则没有触摸文件？

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