从Linux shell脚本调用RSCRIPT

Question

任何人都可以建议我怎么可能会得到这个工作....

我的R脚本，需要几分钟的时间运行，并写几百行的输出。我想写一个围绕这个R脚本的shell脚本包装器，它将在后台启动R脚本，将其输出管道输出到一个文件并开始跟随该文件的底部。如果用户然后输入CTRL-C我想要杀死shell脚本和tail命令但不是R脚本。听起来很简单吧？

我已经在下面制作了一个简化的例子，但我不明白为什么这不起作用。无论何时我杀死shell脚本，尽管R脚本在后台运行，但它也被杀死。我尝试过nohup，disown等没有成功。

example.R

for(i in 1:1000){ 
    Sys.sleep(1) 
    print(i) 
} 

wrapper.sh

​​

提前感谢！

Answer 1

下，似乎我的Ubuntu机器上工作：发送前

#!/bin/bash 

setsid Rscript example.R > logfile.txt & 

tail -f logfile.txt 

---

下面是一些相关流程SIGINT到wrapper.sh：

5361 pts/10 00:00:00 bash 
6994 ?  00:00:02 update-notifier 
8519 pts/4 00:00:00 wrapper.sh 
8520 ?  00:00:00 R 
8521 pts/4 00:00:00 tail 

和Ctrl+C后，您可以看到R仍在运行，但wrapper.sh和tail已被杀害：

5361 pts/10 00:00:00 bash 
6994 ?  00:00:02 update-notifier 
8520 ?  00:00:00 R 

---

虽然与&附加您Rscript [...]命令将其发送到后台，它仍然是相同的过程组的一部分，因此接收SIGINT为好。

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我不知道，如果它是你的意图，但因为你在呼唤tail -f，如果不与Ctrl+c，你的shell运行wrapper.sh将继续将R过程完成后还要挂中断。如果你想避免这种情况，下面应该工作，

#!/bin/bash 

setsid Rscript example.R > logfile.txt & 

tail --pid="$!" -f logfile.txt 

其中"$!"是最后执行的后台进程的进程ID（在Rscript [...]调用）。