OpenMPI为特定节点指定可执行文件

Question

我有一个异构计算群集，我想在使用OpenMPI时运行并行计算任务。由于不是群集中的所有节点都可以运行相同的可执行文件（由于存在异构性），我希望某些节点可以编译它们自己的程序版本，并使Open MPI在这些节点上调用该可执行文件。我的第一个问题是OpenMPI是否支持跨异构体系结构的这种计算。

如果是这样，我的第二个问题是如何指定哪些可执行文件在哪些节点上运行。例如可以说node0，node1和node2可以运行可执行prog1和node3，node4和node5可以运行可执行prog2，其中prog1和prog2是相同的程序，但编译使用mpicc或mpic++包装编译器不同的架构。

如果我想在平行的所有节点，我会做以下运行该程序：

mpirun -n 3 --hosts node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --hosts node3,node4,node5 prog2

如果没有，我会做什么来实现这样的效果？ This post指示异构集群计算受OpenMPI支持，但我必须使用--enable-heterogeneous标志构建OpenMPI。我不知道如何做到这一点，因为我的集群正在运行ArchLinux，并且我使用pacman安装了OpenMPI。

Answer 1

注意有一个错字（--host不需要结束s），所以你的命令应该是

mpirun -n 3 --host node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --host node3,node4,node5 prog2 

--enable-heterogeneous需要如此开放MPI可以在Intel x86_64的之间的异构系统（例如跑出（小端）和sparcv9（大端）节点）。如果OpenMPI（与ArchLinux一起提供）未配置此标志，则应重新构建此包。另一种选择是重建Open MPI并将其安装到备用目录中。

最后但并非最不重要的是，异构支持（非常）轻微测试，我强烈建议您使用最新的Open MPI 3.0系列。