一个R函数来解析命令行参数

Question

我具有低于下面的函数，其中我使用解析命令行参数，这样我可以运行在命令行R脚本：

parseArguments <- function() { 
    text1 <- commandArgs(TRUE) 
    eval(parse(text=gsub("\\s", ";", gsub("--","", text1)))) 
    args <- list() 
    for(ar in ls()[! ls() %in% c("text1", "args")]) {args[ar] <- get(ar)} 
    return (args) 
} 

这里是一个CLI会话输出，当我试图调用R脚本，使用上面的函数解析CL参数，使用以下命令行参数：

./myscript.R --param1='XLIF' --param2='ESX' --param3=5650.0 --param4=5499.2 --param5=0.0027397260274 --param6='Jul' --riskfreerate=0.817284313119 --datafile='/path/to/some/datafile.csv' --imagedir='/path/to/images' --param7=2012 --param8=2 
Error in parse(text = gsub("\\s", ";", gsub("--", "", text1))) : 
    8:10: unexpected '/' 
7: riskfreerate=0.817284313119 
8: datafile=/ 
      ^
Calls: parseArguments -> eval -> parse 
Execution halted 

帮助？

[更新]

我跟了德克的意见，并安装了optparse库。我的代码现在看起来像这样：

library(optparse) 

# Get the parameters 
option_list <- list(
    make_option(c("-m", "--param1"), action="store_false"), 
    make_option(c("-t", "--param2"), action="store_false"), 
    make_option(c("-a", "--param3"), action="store_false"), 
    make_option(c("-s", "--param4"), action="store_false"), 
    make_option(c("-x", "--param5"), action="store_false"), 
    make_option(c("-o", "--param6"), action="store_false"), 
    make_option(c("-y", "--param7"), action="store_false"), 
    make_option(c("-r", "--riskfreerate"), action="store_false"), 
    make_option(c("-c", "--param8"), action="store_false"), 
    make_option(c("-d", "--datafile"), action="store_false"), 
    make_option(c("-i", "--imagedir"), action="store_false") 
) 

# get command line options, i 
opt <- parse_args(OptionParser(option_list=option_list)) 

当我运行将R脚本传递相同的命令行参数，我得到：

Loading required package: methods 
Loading required package: getopt 
Error in getopt(spec = spec, opt = args) : 
    long flag "param1" accepts no arguments 
Calls: parse_args -> getopt 
Execution halted 

???

Answer 1

我回答你的第二个问题，有关错误你optparse遇到：

从make_option帮助页面（...）：

行动：描述行动optparse的字符串在遇到选项时应采取“store”，“store_true”或“store_false”。缺省值为“存储”，表示如果在命令字符串中找到该选项，则optparse应存储指定的下列值：“store_true”如果找到该选项则存储TRUE，如果找到该选项，则存储“FALSE”

总之，你需要使用action = "store"（默认值），如果你想运行类似：

./myscript.R --param1='XLIF' --param2='ESX' [...] 

Answer 2

是的，有CRAN包getopt和optparse只是为此。