从Python加载环境模块

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我无法解决这个问题。我想在这种情况下模块加载一个对齐器 - “领结”。下面是我的代码片段：从Python加载环境模块

import subprocess 
moduleCmd=['module', 'load','/modules/ogi-mbc/software/bowtie/bowtie2-2.2.4/bowtie2'] 
subprocess.Popen(moduleCmd,shell=True)

当我运行我的脚本，我收到以下消息：

cmdModule.c(166):ERROR:11: Usage is 'module command [arguments ...] 

Modules Release 3.2.10 2012-12-21 (Copyright GNU GPL v2 1991): 

Usage: module [ switches ] [ subcommand ] [subcommand-args ]`

程序运行脚本后也不会加载。

测试与子一个简单的命令，如：

testCmd=['ls', '-l'] 
subprocess.Popen(testCmd,shell=True)

我得到预期的输出。

来源

2017-05-29 sudeep

请使用内置的编辑器工具更新您的答案并正确设置代码格式。另外，请添加关于您希望代码执行的说明以及您所得到的结果。 – Soviut

[为什么当args是序列时subprocess.Popen不工作？]（https://stackoverflow.com/questions/2400878/why-subprocess-popen-doesnt-work-when-args-is-sequence）和[其他] [群]（https://stackoverflow.com/questions/20140137/passing-variables-to-subprocess-popen）（https://stackoverflow.com/questions/20140137/passing-variables-到子进程popen）SO问题。 – Evert

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充分利用[链接]（Loading environment modules within a python script）

的提示继工作： cmd=os.popen("/usr/bin/modulecmd python load bowtie/2.2.4) exec(cmd))

柜面他人面临着同样的问题，因为没有别的工作。

注意：使用python/2.7.3，其他环境模块也适用于其他工具。

来源

2017-06-03 02:42:58 sudeep

从Python加载环境模块

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