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我目前正在处理一个数据集,它有很多变量。因此,我决定使用稀疏组LASSO变量选择技术,在SGL包中实施。如何使用SGL包开发物流配送模型?
我的问题是一个后勤问题,这是使用这个包建立可能的模型之一。但是,当我尝试使用它时,我收到一条错误消息。我的数据frameis称为N,和我的二元矢量称为Y:
> x <- as.matrix(N)
> y <- as.matrix(Y)
> data <- list(x, y=y)
> sgl_small <- cvSGL(data, groups, type="logit")
Error: NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)
在之前的情况,Y是零和一的二进制数字矢量,所以我想,这个问题将是Y不是一个因此,我尝试了另一次:
> x <- as.matrix(N)
> y <- as.factor(Y))
> data <- list(x, y=y)
> sgl_small <- cvSGL(data, groups, type="logit")
Error in seq.default(log(max.lam),
log(min.lam), (log(min.lam) - log(max.lam))/(nlam - :
'from' cannot be NA, NaN or infinite
In addition: Warning messages:
1: In mean.default(y) : argument is not numeric or logical: returning NA
2: In mean.default(y) : argument is not numeric or logical: returning NA
3: In Ops.factor(y, m.y) : '-' not meaningful for factors
所以这个错误消息似乎表明y不应该是一个因素。我不知道什么是错误的,特别是因为如果我运行cvSGL函数考虑y作为数字二进制向量,但我建立了一个线性模型而不是一个logit模型(尽管线性模型对我来说不算什么),但它实际上起作用并没有给出任何错误。
我指应用此:
> y <- as.matrix(Y)
> data <- list(x, y=y)
> sgl_small <- cvSGL(data, groups, type="linear")
我要感谢所有帮助,如果任何人试图用这个包来建立一个逻辑模型。
indez参数是一个矢量,它包含构建变量组的信息。就我而言,我通过变量而不是个人来应用层次聚类,以便生成我的变量组。在任何情况下,我都尝试过删除groups参数,并在您获取时重写列表,但它仍显示相同的错误消息:Error:NA/NaN/Inf in foreign function call(arg 1) –
can you tell more more关于数据N,Y? –
当然,我正在处理乳腺癌患者的数据集。我有100个病人(行),列中有20000个基因。这意味着N [i,j] =患者i中基因j的值的量度。这些都是数值,总是大于或等于0.同时,Y是0和1的向量。如果患者没有从癌症中恢复,则其为0,如果他实际上从癌症中恢复,则为1。我遵循的目标是研究哪些基因对患者恢复的影响更大 –