无法在R 3.0在Ubuntu 13.04

安装rJava我不能打电话rJava包R 3.0。我收到以下消息无法在R 3.0在Ubuntu 13.04

Error: package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install it

我试图重新安装rJava软件包时出现错误。我提供了输出R CMD javareconf

Java interpreter : /usr/bin/java 
Java version  : 1.7.0_21 
Java home path : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre 
Java compiler : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javac 
Java headers gen.: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javah 
Java archive tool: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/jar 

trying to compile and link a JNI progam 
detected JNI cpp flags : 
detected JNI linker flags : 
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG  -fpic -O2 -pipe -g -c conftest.c -o conftest.o 
conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory 
compilation terminated. 
make: *** [conftest.o] Error 1 
Unable to compile a JNI program 


Java library path: 
JNI cpp flags : 
JNI linker flags : 
Updating Java configuration in /usr/lib/R 
Done.

我使用的是Ubuntu 13.04。我也试过apt-get install r-cran-rjava这不能帮助解决问题。关于jni.h有一些解决方案here.但是，不知道如何在这里使用解决方案。

来源

2013-05-08 vinux

我遇到了完全相同的问题。我的解决办法是通过

sudo apt-get install openjdk-7-*

安装在OpenJDK-7- *其次，与

sudo R CMD javareconf

和当时我能够通过install.packages("rJava") R中安装rJava。

虽然也许不是最优雅的解决方案，但它似乎解决了我的问题，让rJava工作。

来源

2013-05-09 02:30:57 Peter

谢谢。有效。我曾尝试安装java昨天。我也尝试过Oracle Java，但没有工作。不知道我是在安装JRE还是重新启动了。 – vinux 2013-05-09 04:00:25

对我来说没有运气：前两个步骤没有错误，然后在'install.packages'上得到：'错误：无法加载共享对象'/home/cboettig/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0 /rJava/libs/rJava.so'：''libjvm.so：无法打开共享对象文件：没有这样的文件或目录。有任何想法吗？ – cboettig 2013-09-03 17:20:15

我遇到了同样的问题 - 没有工作。最后发现，在安装Java 1.7后，我不得不告诉Ubuntu使用它作为默认值 - 请参阅[这里]（http://askubuntu.com/questions/64329/how-to-replace-openjdk-6-with-openjdk- 7） - 使用'update-java-alternatives -l'来获取安装的java版本列表，以及'sudo update-java-alternatives -s java-1.7.0-openjdk-i386'默认为1.7。在这之后，'sudo R CMD javareconf'运行时没有错误，并且我能够'install.packages（“rJava”）' – JohnSG 2014-05-21 18:06:30

对于那些收到错误：

error: unable to load shared object '/some/dir/rJava/libs/rJava.so': libjvm.so: 
cannot open shared object file: No such file or directory

我解决了这个错误在系统中查找库和连接它们/usr/lib：

$sudo updatedb 
$locate libjvm.so 
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so 
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so 
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so 
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so 
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so 
$sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib/

来源

2014-02-01 22:12:34 kahlo

从分发包安装rJava在this askUbuntu answer建议也适用：

sudo apt-get install r-cran-rjava

N OTE：从Debian系统尝试。

来源

2017-08-29 21:10:03 atfornes

无法在R 3.0在Ubuntu 13.04

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