在Dockerfile中添加用于从Github安装的R软件包

如何在我的Dockerfile中使用github添加R软件包的安装指令。在Dockerfile中添加用于从Github安装的R软件包

R中的环境通常的命令是：

devtools::install_github("smach/rmiscutils")

但没有成功为止。试图GitHub库添加到安装说明：

RUN install2.r --error \ 
    -r 'http://cran.rstudio.com' \ 
    -r 'http://github.com/smach/rmiscutils'

但我得到一个错误：

error in download. Status was '404 Not found'

也许用香草[R通话，但找不出命令。任何提示？

2017-04-01 Forge

您是否使用从泊坞枢纽正式R图像时，这里添加的命令？ https://hub.docker.com/_/r-base/ – thaJeztah

rocker/rstudio基于r服务器 – Forge

试试这个：

RUN installGithub.r smach/rmiscutils \ 
&& rm -rf /tmp/downloaded_packages/

一个好的做法是去除所有下载的软件包，以缩小图像尺寸。

安装从Bioconductor的（万一有人在这里结束寻找帮助）

RUN install2.r -r http://bioconductor.org/packages/3.0/bioc --deps TRUE \ 
    phyloseq \ 
    && rm -rf /tmp/downloaded_packages/

2017-04-04 18:53:10 useRj

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