2015-03-02 158 views
0

我会尽我所能来解释我的问题,所以我很抱歉如果这篇文章的部分是令人困惑。我有两列数据,如下所示: -从java导出数据到excel

enter image description here刚刚有6000多行。我想要做的是获取其rt值在2范围内的每个mz值之间的差异。因此,例如,使用此帖子上的图像,第2行(100.9035)中的mz值和第2行中的mz值6(102.9007)的RT值分别为8.07和7.36,即RT值相差在2以内。由此,我想从第二个减去第一个mz值的值来计算差异,然后将这些信息导出到excel中。我希望对所有在2秒范围内(不是+或 - 2)的mz值进行此过程。

为此,我首先将mz和rt值分隔成两个单独的文本文件,然后创建一个2d双精度数组,并从两个文件中填充数组(这可能是一个不必要的方法,但我的级别的脚本是非常简单的)。这样做之后,我通过使用if和for条件遍历数组来找到彼此相距2 rt内的mz值并获取它们之间的差异。这是我用Java编写的,到目前为止脚本: -

import java.io.BufferedReader; 
import java.io.FileNotFoundException; 
import java.io.FileOutputStream; 
import java.io.FileReader; 
import java.io.IOException; 

import org.apache.poi.hssf.usermodel.HSSFWorkbook; 
import org.apache.poi.hssf.usermodel.HSSFWorkbook; 
import org.apache.poi.ss.usermodel.Cell; 
import org.apache.poi.ss.usermodel.Row; 
import org.apache.poi.ss.usermodel.Sheet; 
import org.apache.poi.ss.usermodel.Workbook; 

public class qexactiveDiff { 

    public static void main(String[] args) throws IOException { 

     Workbook wb = new HSSFWorkbook(); 
     Sheet sheet1 = wb.createSheet("Data"); 
     Sheet sheet2 = wb.createSheet("AdditionalData"); 


     double[][] mzValues = new double[6427][2]; 

     BufferedReader mzBr = new BufferedReader(new FileReader(
       "C:/Users/colles-a-l-kxc127/workspace/Maldi/src/Neg_mzs.txt")); 

     BufferedReader rtBr = new BufferedReader(new FileReader(
       "C:/Users/colles-a-l-kxc127/workspace/Maldi/src/Neg_rts.txt")); 

     String mzLine = mzBr.readLine(); 

     String rtLine = rtBr.readLine(); 

     for (int i = 0; i < 6427; i++) { 

      if (mzValues != null || rtLine != null) { 

       mzValues[i][0] = Double.parseDouble(mzLine); 

       mzValues[i][1] = Double.parseDouble(rtLine); 

       mzLine = mzBr.readLine(); 

       rtLine = rtBr.readLine(); 

      } 

     } 

     for (int i = 0; i < 6427; i++) {  //6427 is num of rows  


      Double rt = mzValues[i][1]; 
      Double mz = mzValues[i][0]; 

      Row row = sheet1.createRow(i); 
      Row row2 = sheet2.createRow(i); 
      Cell cell = row.createCell(0); 
      Cell cell2 = row2.createCell(0); 

      cell.setCellValue(mz); 

     // System.out.println("Mz: " + mz + " | " + "RT: " + rt); 

      for (int j = 0; j < 6427; j++) { 

       Double rt2 = mzValues[j][1]; 

       Double mz2 = mzValues[j][0]; 

       Double rtDiff = rt2 - rt; 

       int counter = 0; 

       if (rtDiff < 2 && rtDiff > -2) { 

        counter++; 

        if(counter < 255){ 

         cell = row.createCell(j + 1); 
         cell.setCellValue(mz2 - mz); 

        } 

        else{ 

         cell2 = row.createCell(j + 1); 
         cell2.setCellValue(mz2 - mz); 

        } 

      //  System.out.println("Index: " + j + " Mz difference: " 
      //    + (mz2 - mz) + " RT: " + rt2); 

       } 
      } 

     } 

     try { 

      FileOutputStream output = new FileOutputStream("Data.xls"); 
      wb.write(output); 
      output.close(); 

     } catch (Exception e) { 

      e.printStackTrace(); 
     } 

    } 

} 

这可能是一个有点难以遵循这是很肮脏的脚本,但我只是想获得基本的工作。我注意到,当我试图做到这一点之前,我不断提出一个关于列范围的错误,因为我写的数据超出了电子表格允许的列范围,所以我试图设计一种方法,继续编写一旦数据超出列范围(通过在代码中使用计数器实现的255列),将数据转移到另一个表中,但我仍然收到错误消息。我知道java并不是执行此任务的最理想的工具,但它是我唯一具有一定经验的语言。有没有办法导出数据,以便我可以克服允许的列范围问题?

谢谢

+0

真的没有想到这样做的那方式,虽然我不知道我将如何去在Excel中做它 – user2062207 2015-03-02 15:29:52

+0

您是否超出了sheet1或sheet2上的列限制? – 2015-03-02 15:34:06

+0

您是否考虑尝试使用.xslx来解决列限制问题? – Compass 2015-03-02 15:34:22

回答