2013-04-10 74 views
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我需要计算图形中两个顶点之间最短路径的边缘属性的乘积。如何在igraph(R)中执行最短路径时获取边缘属性列表

例如:

data<-as.data.frame(cbind(c(1,2,3,4,5,1),c(4,3,4,5,6,5),c(0.2,0.1,0.5,0.7,0.8,0.2))) 
G<-graph.data.frame(data, directed=FALSE) 
set.edge.attribute(G, "V3", index=E(G), data$V3) 

如果我根据我有两个posibilities属性计算的最短路径,所述第一告诉我以下步骤:

get.shortest.paths (G, 2, 6, weights=E(G)$V3) 

第二个告诉我路径属性的总和。

shortest.paths (G, 2, 6, weights=E(G)$V3) 

1.8

因为我需要做一个产品,我需要有边缘的矢量我的道路的节点间的属性。在这个例子中,我应该得到0.8 0.2 0.2 0.5 0.1,其产品将是0.0016。 任何人都可以建议我如何做到这一点?

回答

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使用output说法get.shortest.paths

library(igraph) 
data <- data.frame(from =c(1, 2, 3, 4, 5, 1), 
        to =c(4, 3, 4, 5, 6, 5), 
        weight=c(0.2,0.1,0.5,0.7,0.8,0.2)) 
G <- graph.data.frame(data, directed=FALSE) 

esp26 <- get.shortest.paths(G, 2, 6, output="epath")[[1]] 
esp26 
# [1] 2 3 1 6 5 

prod(E(G)$weight[esp26]) 
# [1] 0.0016 

plot(G, edge.label=paste("Id:", 1:ecount(G), "\n", "W:", 
      E(G)$weight, sep="")) 

plot