我有一个看起来像删除线
geneA geneB 134
geneC geneF 395
geneH geneD 958
geneF geneC 395
geneB geneA 134
geneD geneH 958
我想删除具有相同的基因(即在相反的顺序)行的文件,所以我只是得到
geneA geneB 134
geneC geneF 395
geneH geneD 958
我有这个到目前为止,但当我尝试使用replace()或if语句时,我得到更多的重复。任何想法如何我可以改变这一点?
with open(filename, 'r') as handle, open(outfilename, 'a') as w:
for line in handle:
element = line.split()
gene1 = element[0]
gene2 = element[1]
for line in handle:
matchingelement = line.split()
gene3 = matchingelement[0]
gene4 = matchingelement[1]
if gene3 == gene2 and gene4 == gene1:
"""Remove the line"""
“删除此行”是指删除它并再次写入相同的文件或删除它并将结果写入新文件? –
具有相同基因的线条最终总是具有相同的数字吗? –
我想写任何留给新文件的东西。它们将始终具有相同的数字,但我试图避免使用这种情况,以防万一两个基因之间的连接碰巧具有与另外两个基因之间的连接相同的值。 –