素食主义者包中的vegdist错误消息

Question

我正在尝试在R中使用素数包，将数据集作为列和物种数作为列进行计算。我的数据格式为文本文件（制表符分隔），并包含大量'0'物种计数。然而，当我尝试创建一个距离矩阵我得到以下错误消息：

嘶叫< - vegdist（DATA1，方法= “布雷”）
警告信息： 1：在vegdist（DATA1，方法=“布雷”）： 你有空行：他们的不同点可以是在方法“布雷” 2无意义：在vegdist（DATA1，方法=“布雷”）：在结果中缺失值

这防止箱从执行NMDS：

> nmds <- metaMDS(data1, k = 2, 
+   distance = 'bray', autotransform = FALSE) 
Error in if (any(dist < -sqrt(.Machine$double.eps))) warning("some dissimilarities are negative -- is this intentional?") : 
    missing value where TRUE/FALSE needed 
In addition: Warning messages: 
1: In distfun(comm, method = distance, ...) : 
    you have empty rows: their dissimilarities may be meaningless in method “bray” 
2: In distfun(comm, method = distance, ...) : missing values in results 

我该如何解决这个问题？

谢谢你的回答！

Answer 1

某些列只包含0个计数。删除这些将使其工作