使用在一个bash脚本循环变量来传递不同的命令行参数

我有使用使用在一个bash脚本循环变量来传递不同的命令行参数

int main(int argc, char *argv[]){ 
    double a,b; 
    a = atof(argv[1]); 
    b = atof(argv[2]); 
    further code.....

我上运行的代码C++程序，其余传递两个兼作从命令行输入使用qsub实用性和我有一个名为“bash脚本jobsub.sh`提交它看起来像这样

#!/bin/csh -f  
hostname       
cd /home/roy/codes/3D    # change directory first -- replace Mysubdir 
set startdir = `pwd`    # remember the directory we're in 
if(! -d /scratch/$USER) then 
    mkdir /scratch/$USER  # create scratch directory 
endif        # if it does not exist 
#cp infile12 /scratch/$USER  # copy input file to scratch directory 
cd /scratch/$USER     # change to scratch directory 
#rm *.* 
$HOME/codes/3D/autoA100.out 2.1 2.2   # run a program 
cp * $startdir   # copy outputfiles back to where we started

在我做终端的作业集群

但是，我想在不同的内核上并行运行a和b不同值的同一个可执行文件。是否有可能写在bash脚本循环，这样我可以做类似，

for i=1;i<=10;i++ { 
    $HOME/codes/3D/autoA100.out 2+i*0.1 2+i*0.2 
}

来源

2012-07-06 lovespeed

您的“bash”脚本类似于bash，但包含许多语法错误。 – jordanm 2012-07-06 01:21:20

@jordanm：在某些方面，它看起来像csh（例如'set'）。 – 2012-07-06 02:05:05

@DennisWilliamson：是的，它看起来像csh – 2012-07-06 05:56:06

您可以随时在后台运行的作业（在这种情况下，外壳将继续执行下一条指令）

MY_PIDS= 
for i in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 
do 
    yourjob "$(a i)" "$(b i)" & # Note the ampersand (background) 
    MY_PIDS="$MY_PIDS "$!   # Do not write the $! inside the quotes, bash will 
            # break (better, don't use bash but plain sh) 
done 

# Wait wor each job to complete and cleanup 
for p in $MY_PIDS 
do 
    wait "$p" 
    echo "Return code of job $p is $?" 
    do_cleanup_for "$p" 
done

但可以肯定，你需要确保在并行运行的作业不会踩着对方的脚（如写入同一文件）。

来源

2012-07-06 00:26:27

引用$！在交互式shell中只是一个问题。 – jordanm 2012-07-06 01:35:11

足够的问题，不要在上面引用它，我会说。 – 2012-07-06 01:37:23

是否有你使用字符串来存储pids而不是数组的原因？ – jordanm 2012-07-06 01:43:26

如果您提交的执行脚本批量加载器，那么有没有办法有像你想要的，因为整个脚本上每个节点运行一个简单的循环做执行。但是，大多数批量加载器为用户提供了环境变量。

例如，PBS有$PBS_ARRAYID，它指定作业运行时的唯一ID。因此，而不是使用一个循环，你的脚本可以有：

a=$(echo "2+($PBS_ARRAYID+1)*0.1" | bc -l) 
b=$(echo "2+($PBS_ARRAYID+1)*0.2" | bc -l) 
$HOME/codes/3D/autoA100.out $a $b

通知我添加1到$PBS_ARRAYID以上，因为ID从0开始，而你的循环从1开始。还值得一提的是，尽管bash可以在本地进行一些算术运算，但它无法处理实数;这就是为什么我必须调用bc。

来源

2012-07-06 00:26:40 chrisaycock

它可以处理一些实数，整数。它不能做浮点数学。 – jordanm 2012-07-06 01:30:11

@chrisaycock抱歉复活这个旧帖子，但从来没有一个公认的解决方案;你说：“没有办法像你想要的那样用简单的循环执行执行，因为整个脚本都在每个节点上运行。”这是如何解决使用两个脚本，一个用于循环，一个用于qsub？ – 2013-08-25 05:29:46

使用在一个bash脚本循环变量来传递不同的命令行参数

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