如果声明和写入文件

我正在使用KEGG API下载基因组数据并将其写入文件。总共有26个文件，其中一些包含字典'COMPOUND'。我想将这些分配给CompData并将它们写入输出文件。我试图把它写成True if语句，但这不起作用。如果声明和写入文件

#Read in hsa links 

hsa = [] 
with open ('/users/skylake/desktop/pathway-HSAs.txt', 'r') as file: 
    for line in file: 
     line = line.strip() 
     hsa.append(line) 

#Import KEGG API Bioservices | Create KEGG Variable 
from bioservices.kegg import KEGG 
k = KEGG() 

#Data Parsing | Writing to File 
#for i in range(len(hsa)): 
data = k.get(hsa[2]) 
dict_data = k.parse(data) 
if dict_data['COMPOUND'] == True: 
    compData = str(dict_data['COMPOUND']) 
nameData = str(dict_data['NAME']) 
geneData = str(dict_data['GENE']) 
f = open('/Users/Skylake/Desktop/pathway-info/' + nameData + '.txt' , 'w') 
f.write("Genes\n") 
f.write(geneData) 
f.write("\nCompounds\n") 
f.write(compData) 
f.close()

来源

2017-02-18 Quintakov

你的意思是“这不起作用”。例如。它会引发错误吗？ – Kanak

如果我在真正运行的东西下面添加一个else语句，它会运行，这意味着条件是错误的。 – Quintakov

我想通过

if dict_data['COMPOUND'] == True:

你测试（错误地）的字符串中dict_data关键'COMPOUND'的存在。在这种情况下，你想要的是

if 'COMPOUND' in dict_data:

而且，请注意，如果该键不存在，试图写它的价值时将产生错误不会发生变化compData的定义。这意味着无论发生什么事，你都应该定义它，例如，

compData = str(dict_data.get('COMPOUND', 'undefined'))

上面的代码线意味着如果键存在它得到其值，并且如果不存在，则它得到'undefined'代替。请注意，您可以选择所需的替代值，或者甚至不给出任何值，默认情况下会导致None。

来源

2017-02-18 03:18:11 Kanak

如果声明和写入文件

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