2017-03-04 147 views
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我有这样的数据集:Python,计算二项式P值:这段代码是否正确?

ItemNumber Successes Trials Prob 
15   14   95  0.047 
9625  20   135  0.047 
19   14   147  0.047 
24   12   120  0.047 
20   15   133  0.047 
22   8   91  0.047 
9619  16   131  0.047 
10006  8   132  0.047 
25   15   127  0.047 

欲识别culmulative二项式分布p值对每个项目,了解观察项目出现的相同或更高数目的概率。

我用这个代码:

import sys 
import scipy 
from scipy.stats.distributions import binom 
import sys 

for line in open(sys.argv[1], 'r').readlines(): 
    line = line.strip().split() 
    Item,num_succ,num_trials,prob = line[0],int(line[1]),int(line[2]),float(line[3]) 
    print Item + "\t" + str(num_succ) + "\t" + str(num_trials) + "\t" + str(prob) + "\t" + str(1 - (binom.cdf(num_succ, num_trials, prob))) 

输出看起来是这样的:

Item NumSucc NumTrials Prob Binomial 
15  14  95   0.047 3.73e-05 
9625 20  135  0.047 1.48e-06 
19  14  147  0.047 0.004 
24  12  120  0.047 0.0043 
20  15  133  0.047 0.00054 
22  8  91   0.047 0.027 
9619 16  131  0.047 0.0001 
10006 8  132  0.047 0.169 
25  15  127  0.047 0.0003 

的问题:当我挑一条线,并检查所获得的累积二项式P值对像一个在线工具这个:http://stattrek.com/online-calculator/binomial.aspx,结果不一样。

例如,

对于项目20(#成功= 15,#试验= 133,习题= 0.047):

My Binomial P Val = 0.00054 
StatTrek P Val = 0.0015 

不过,我可以从StatTrek看到,我已经看过因为我想要“等于或大于”,我实际上想要计算的是P(X> = 15)(它是0.0015)。

我竭力要正确编辑上面的代码,改变从返回P值“找到发病率大于数”“找到发生率大于或等于数量”。如果有人能证明我会感激。如果你看看this question,我试图关注Volodymyr的评论。

回答

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二项分布是一个离散分布。因此,下列情况属实:P(X> 14)= P(X> = 15) 。如果binom.cdf计算P(X> N)的概率(是吗?我没有找到它的文档),如果你想要将它改为P(X> N-1)测试P(X> = N)。