一个功能为bigglm模型选择像glm的疏浚工作

我使用glm与dredge在MuMIn包。但现在，因为我的数据很大，我使用biglm包中的bigglm。现在我该如何做模型选择，因为dredge不适用于bigglm？是否有另一个我可以用来实现这个目标的软件包？一个功能为bigglm模型选择像glm的疏浚工作

在施加上bigglm的dredge我收到以下错误：

Error in nobs.default(global.model) : no 'nobs' method is available

来源

2017-06-05 user13892

dredge依赖于logLik方法的可用性对于给定的模型类。 big[g]lm对象不提供这样的值，并且看起来有一个AIC方法的big[g]lm-类，这使得它不可能从它计算LL（它使用偏差而不是LL来计算AIC，因此AIC值为与其他型号不具有可比性，请参阅：AIC different between biglm and lm）。

你可以尝试添加缺少的方法（用越轨行为，而不是LL，这可能是滑）：

# incorrect if any prior weights are 0 
nobs.biglm <- function (object, ...) object$n 

logLik.bigglm <- function(object, ...) { 
    dev <- deviance(object, ...) 
    df <- object$n - object$df.resid 
    structure(dev, df = df, nobs = object$n) 
} 

coefTable.biglm <- function (model, data, ...) { 
    ct <- summary(model)$mat[, c(1L,4L,5L), drop = FALSE] 
    .makeCoefTable(ct[, 1L], se = ct[, 2L], df = model$df.resid, coefNames = rownames(ct)) 
} 
environment(coefTable.biglm) <- asNamespace("MuMIn") 

#from example(bigglm) 

fm <- bigglm(log(Volume)~log(Girth)+log(Height),data=trees, chunksize=10, sandwich=TRUE) 
dredge(fm, rank = AIC)

来源

2017-06-05 13:22:11

一个功能为bigglm模型选择像glm的疏浚工作

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