将一列零添加到csr_matrix中

我有一个MxN稀疏csr_matrix，我想在矩阵的右侧添加只有零的几列。原则上，阵列indptr,indices和data保持不变，所以我只想改变矩阵的尺寸。但是，这似乎没有实施。将一列零添加到csr_matrix中

>>> A = csr_matrix(np.identity(5), dtype = int) 
>>> A.toarray() 
array([[1, 0, 0, 0, 0], 
     [0, 1, 0, 0, 0], 
     [0, 0, 1, 0, 0], 
     [0, 0, 0, 1, 0], 
     [0, 0, 0, 0, 1]]) 
>>> A.shape 
(5, 5) 
>>> A.shape = ((5,7)) 
NotImplementedError: Reshaping not implemented for csr_matrix.

也水平堆叠零矩阵似乎没有工作。

>>> B = csr_matrix(np.zeros([5,2]), dtype = int) 
>>> B.toarray() 
array([[0, 0], 
     [0, 0], 
     [0, 0], 
     [0, 0], 
     [0, 0]]) 
>>> np.hstack((A,B)) 
array([ <5x5 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>' 
    with 5 stored elements in Compressed Sparse Row format>, 
     <5x2 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>' 
    with 0 stored elements in Compressed Sparse Row format>], dtype=object)

这是我最终想达到的。有没有一种快速的方法来重塑我的csr_matrix而不复制所有内容？

>>> C = csr_matrix(np.hstack((A.toarray(), B.toarray()))) 
>>> C.toarray() 
array([[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], 
     [0, 1, 0, 0, 0, 0, 0], 
     [0, 0, 1, 0, 0, 0, 0], 
     [0, 0, 0, 1, 0, 0, 0], 
     [0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]])

来源

2014-10-20 physicalattraction

你想要做的不是真正的numpy或scipy理解为重塑。但是，对于您的特定情况下，你可以创建一个新的CSR矩阵重用data，从原来的一个indices和indptr，无需将其复制：

import scipy.sparse as sps 

a = sps.rand(10000, 10000, density=0.01, format='csr') 

In [19]: %timeit sps.csr_matrix((a.data, a.indices, a.indptr), 
...        shape=(10000, 10020), copy=True) 
100 loops, best of 3: 6.26 ms per loop 

In [20]: %timeit sps.csr_matrix((a.data, a.indices, a.indptr), 
...        shape=(10000, 10020), copy=False) 
10000 loops, best of 3: 47.3 us per loop 

In [21]: %timeit sps.csr_matrix((a.data, a.indices, a.indptr), 
...        shape=(10000, 10020)) 
10000 loops, best of 3: 48.2 us per loop

所以，如果你不再需要原来的矩阵a，因为默认是copy=False，简单地做：

a = sps.csr_matrix((a.data, a.indices, a.indptr), shape=(10000, 10020))

来源

2014-10-20 15:58:33 Jaime

您可以使用scipy.sparse.vstack或scipy.sparse.hstack做得更快：

from scipy.sparse import csr_matrix, vstack, hstack 

B = csr_matrix((5, 2), dtype=int) 
C = csr_matrix((5, 2), dtype=int) 
D = csr_matrix((10, 10), dtype=int) 

B2 = vstack((B, C)) 
#<10x2 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>' 
#  with 0 stored elements in COOrdinate format> 

hstack((B2, D)) 
#<10x12 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>' 
#  with 0 stored elements in COOrdinate format>

注意，输出的是coo_matrix，它可以有效地转换为CSR或CSC格式。

来源

2014-10-20 10:02:03

将一列零添加到csr_matrix中

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