MPI并行写入TIFF文件

我正在尝试在MPI代码中写入TIFF文件。不同的处理器具有不同的图像部分，我想将图像并行写入文件。MPI并行写入TIFF文件

的写入失败，只有第一处理器能够写入。

我该怎么做？

有我的执行没有错误，只是它不工作。
我用h=TIFFOpen(file, "a+")每个处理器上使用TIFFSetDirectory(h, directorynumber)打开同一个文件（我不知道这是否是一个正确的方式或没有），那么每个谁负责的目录处理器将写在了自己的位置的头，然后每个目录的内容将被写入。我将用TIFFWriteDirectory(h)完成。结果将是写在文件上的第一个目录。

我想，我需要使用MPI_IO但这样做的方式是不TIFFOpen打开文件？

来源

2014-01-28 ziv

你在想什么？结果是什么？什么是错误？在我们能够帮助您之前，我们需要更多信息。 –

并行libtiff是否有任何开源解决方案？真的很难相信没有人会试图为tiff库编写并行IO。 – ziv

不同MPI任务是独立的程序，从上来看OS点独立主机上运行。在你的情况下，TIFF库不是为了处理并行操作而设计的，所以打开文件将导致第一个进程成功，其余的都会失败，因为他们发现文件已经打开（在共享文件系统上）。除了在处理巨大的图像（例如：天文图像）的情况下，执行并行I/O对性能很重要（您需要支持它的文件系统......但我知道IBM GPFS），我会避免使用MPI_IO编写自定义TIFF驱动程序。

取而代之的是典型的解决方案是收集（MPI_Gather（））与等级== 0过程中的图像部分，让它只保存TIFF文件。

来源

2014-01-30 10:53:33 Sigismondo

只是一个愚蠢的想法：也许为图像的每个块写一个文件，然后有一个简单的合并块的后构建步骤？实际上，这种方法可能需要一个定制的TIFF库（这是OP可能使用的任何方式）...... –

并非毫无意义:) MPI并不总是最好的工具。但我期望后续是“如何收集图像” - 在这里MPI数据类型可以有很大的帮助 - 它取决于图像的分布。 OP提到的库只是[libtiff]（http://www.unix.com/man-page/all/3tiff/TIFFSetDirectory/）。 – Sigismondo

这是真的:)但是，传递块可能会很慢...或者MPI知道如何将指针传递到内存中的位置？ MPI是否使用共享内存模型？ –

MPI并行写入TIFF文件

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