我是Jupyter笔记本新手,我试图用rpy2来设置一个与Python和R.我有给我的错误的SyntaxError行%%细胞魔术标签不工作Jupyter笔记本?
%%R -i df
:无效的语法
然而,当我只用一个%,如
%R require(ggplot2)
能正常工作。我该如何解决这个问题?我正在使用Python 2.7。
我是Jupyter笔记本新手,我试图用rpy2来设置一个与Python和R.我有给我的错误的SyntaxError行%%细胞魔术标签不工作Jupyter笔记本?
%%R -i df
:无效的语法
然而,当我只用一个%,如
%R require(ggplot2)
能正常工作。我该如何解决这个问题?我正在使用Python 2.7。
%
前缀为换行符,而%%
前缀为换行符。
%%R # <-- must be the only instruction on this line
{body of cell in R code}
而:
%R {one line of R code}
我没有安装R,但我认为你可能想叫R上的bash命令;在这种情况下,用!
调用命令:
!R -i df
举例来说,如果我输入!python -i
,我得到的信息对我目前的Python环境:
Python 3.6.2 |Anaconda custom (x86_64)| (default, Jul 20 2017, 13:14:59)
[GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 6.0 (clang-600.0.57)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>>
谢谢,这工作。 –
太棒了,很高兴我能帮上忙。 –
这是一个老问题,但我跑今天进入同样的问题。 Reblochon Masque的答案从今天起不再适用。 %%R -i df
在细胞中间抛出invalid syntax
。 !R -i df
也会抛出WARNING: unknown option '-i' ARGUMENT 'df' __ignored__
。
这是我需要做的细胞魔法R
工作:
遵循this instruction安装R
包RJSONIO
和httr
(包名称确实是小写),Python
包rpy2
。不需要进一步的配置。
只放一行%load_ext rpy2.ipython
在一个单元格中调用rpy2
。
%%R
必须在一个单元格的开头,所以我把这一行放在下一个单元格中。
%%R
后单元格的主体不能为空。
%%R -i df
确实按预期工作。
你能用一个例子来说明你的观点吗? – Vin
'%'前缀是用于行魔术,而'%%'前缀是用于单元格魔术 –
你知道为什么单元魔术字前缀给出语法错误,而行魔术前缀不行吗?我加载了rpy2.ipython。 –
是的,细胞魔法必须是该线上的唯一指令,并且细胞的主体不能为空。 (见下面的答案) –