在R中，如何根据另一个对象的类来设置S4类

我需要从Bioconductor的ShortRead库创建ShortReadQ类型的对象。在R中，如何根据另一个对象的类来设置S4类

ShortReadQ 'signature(sread = "DNAStringSet", quality = 
      "QualityScore", id = "BStringSet")'

质量时隙必须是一个对象从继承的QualityScore，其中我可以很容易地从我希望模拟另一ShortReadQ对象确定。

> class(quality(anotherObject)) 
[1] "SFastqQuality" 
attr(,"package") 
[1] "ShortRead"

在构造函数参数中使用该信息（“SFastqQuality”）的最佳方式是什么？

newObject<-ShortReadQ(sread=..., 
      quality=SFastqQuality(...), 
      id=...)

我不明白这个问题。你可能想尝试进一步澄清你的问题，或尝试bioconductor的帮助：http://www.bioconductor.org/docs/postingGuide.html。 – Shane 2010-03-02 01:21:26

我想获得给定对象的类名，并在新对象的构造函数中使用它。什么是最好的方式来做到这一点？ – 2010-03-02 02:29:40

感谢您的答复。他们导致我的解决方案工作

newObject<-ShortReadQ(sread=..., 
      quality=new(Class=class(quality(anotherObject)),theFirstParameter=...), 
      id=...)

2010-03-02 20:10:35

这是做你想做的吗？

quality = new(class(old.quality.obj)[[1]]))

2010-03-02 04:25:11

你可能想get函数：

a <- get(class(object)) 
a(...)

2010-03-02 04:50:00 Shane

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