如何删除所有符号以创建制表符分隔文件？

>Mouse|chr1:52136377-52136981 | element 1 | negative 
    >Mouse|chr15:52166424-52166999 | element 2 | negative

我想要的输出为制表符分隔这样的：

Mouse chr1 52136377 52136981 element 1 negative 
    Mouse chr15 52166424 52166966 element 2 negative

这对我来说非常棘手，因为我非常新正则表达式和sed。我尝试使用sed删除所有符号，如: , | , - , and >，并插入一个选项卡，但它不起作用。

谢谢你的帮助！

2017-06-22 momo12321

请张贴'sed'尝试。 –

'perl -lne'print join“\ t”，split \ \ W + /'file' –

'perl -F \\ W + -le'print join“\ t”，@ F'file' –

尝试更换这样的：有一个\t[>|:\- ]+ ...

2017-06-22 12:08:31

OP在sed中使用这种模式可能会有问题（这在POSIX中是无效的）。 –

哪部分无效？ –

在BRE POSIX中，'+'匹配文字'+'，它们不支持括号表达式中的转义序列。所以，在括号表达式中间的'-'会形成一个无效范围（ERE和BRE）。 –

扩展的sed方法：

sed -E 's/ *[>\|:-] */\t/g' file

输出：

Mouse chr1 52136377 52136981 element 1 negative 
    Mouse chr15 52166424 52166999 element 2 negative

2017-06-22 12:11:30 RomanPerekhrest

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