2017-04-12 45 views
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我试图实现家庭数据的EM算法,我假设我的观察具有多变量t分布。我每个家庭只有两个兄弟姐妹,所以所有的家庭组都只有两个观察。基本上我试图按照这篇文章中的E(C)M步骤: https://pdfs.semanticscholar.org/9445/ef865c4eb1431f9cb2abdb5efc1c361172cc.pdf多变量t混合模型的EM算法

但是,现在我不确定EM是否适合这种数据,家庭的对角线。

因此,这里是我的家庭结构如何

fam_id = sort(rep(1:5, 2)) 

Z= matrix(0, nrow = length(fam_id), ncol = length(unique(fam_id))) 
colnames(Z) = unique(fam_id) 

k = 1 
i = 1 
# Random effects dummy matrix 
while (k <= ncol(Z)) { 
    Z[i:(i+1), k] = c(1, 1) 
    k = k +1 
    i = i+2 
} 

> Z 
    1 2 3 4 5 
[1,] 1 0 0 0 0 
[2,] 1 0 0 0 0 
[3,] 0 1 0 0 0 
[4,] 0 1 0 0 0 
... 

5日迭代说,相关矩阵的PSI后不EM算法扼流圈的R例如:

在solve.default错误(psi_hat ): 系统在计算上是单数

如果任何人都可以对此有所了解,我会非常高兴!

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