1. 首页
  2. 问答
  3. 1.4.3平行--pipe到文件

1.4.3平行--pipe到文件

2017-04-05 65 views
2

我使用在bash以下命令，该命令写入从bcftools输出经由>到所需的文件1.4.3平行--pipe到文件

bcftools reheader -s samples.txt input_file.vcf > output_file.vcf

我想使用平行于多个文件执行此，尝试下面，但不太工作...

parallel --pipe bcftools reheader -s samples.txt input_file.{}.vcf -f out_file.{}.vcf ::: {01..10}

如何从每个并行进程写入STDOUT到单个文件？

来源

2017-04-05 user3234810

回答

2

如果您的问题是，你要使用>传递给GNU命令中的并行，你可以做到这一点通过单一引用命令：

parallel 'doSomething > {}.log' ::: a b c

或逃避：

parallel doSomething \> {}.log ::: a b c

来源

2017-04-05 12:38:32

+1

但也试试：parallel --results mydir bcftools reheader -s samples.txt input_file。{}。vcf -f out_file。{}。vcf ::: {01..10} –

相关问题

 相关问题