2017-08-01 45 views
-4

我需要帮助启动/编写一个R脚本,它可以与另一个脚本文件交叉检查一个.txt文件,以查找存在多个实例的位置。我有一个带有一个miRNA列表的excel文件,我想与另一个包含相同miRNA名称的列的Excel文件交叉引用。与R交叉检查两个文本文件

回答

0

那么它是一个文本文件或Excel文件导入?没有更多的细节,文件结构或可重复的例子,这将很难提供帮助。

你可以试试:

# Get the correct package 
install.packages('readxl') 

df1 <- readxl::read_excel('[directory name][file name].xlsx') 
df2 <- readxl::read_excel('[directory name][file name].xlsx') 

# Creates a new variable flag if miRNA from your first dataset is in the second dataset 
df1$is_in_df2 <- ifelse(df1$miRNA %in% df2$miRNA, 'Yes', 'No') 
+0

我可以导入这两种格式,我不认为这会事。我目前有他们在Excel格式。基本上,我想要做的只是将第一个文件与miR名称进行交叉检查,然后指出哪个基因与miR名称相关联。 –