如何使用H5PY将HDF5文件导出到NumPy？

我有一个现有的三个数组hdf5文件，我想用h5py提取其中一个数组。如何使用H5PY将HDF5文件导出到NumPy？

2012-04-23 l.z.lz

h5py作为numpy的阵列已经读取的文件，所以只是：

with h5py.File('the_filename', 'r') as f: 
    my_array = f['array_name'][()]

[()]该装置读取整个阵列中;如果你不这样做，它不会读取整个数据，而是让你懒地访问子部分（当数组很大时非常有用，但只需要一小部分）。

来源

2012-04-23 03:36:10 Dougal

非常感谢Dougal.I修改了代码：>>> f = h5py.File（'D：/！JODI/Macau Wind/u_100m/20100101.hdf5'，'r'） my_array = f [ 'u']。值 f.close（）另一个愚蠢的问题是put putray是在一个文件中？我在哪里可以找到输出数组？非常感谢你 – 2012-04-23 03:55:59

我不确定你的输出数组是什么意思：'my_array'从上面？除非你自己保存（到'h5py.File'或类似'numpy.save'的东西），否则你所做的任何更改都只会存储在内存中。 – Dougal 2012-04-23 07:13:50

对于后人：'.value'方法不再有效。改用'f ['array_name'] [（）]'。 – Dougal 2014-01-04 21:29:49

对于这个问题它是过度杀伤，但如果你有很多这样的事情做我使用包SpacePy，使一些这更容易。

datamodel.fromHDF5() documentation这将返回一个数组字典，其存储方式类似于h5py处理数据的方式。

来源

2012-04-24 20:55:09

如何使用H5PY将HDF5文件导出到NumPy？

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