定义哈希值和密钥并使用多个不同的文件

我很努力地为几个任务编写一个Perl程序。自从我是初学者并且想要了解我的错误之后，我已经非常努力地检查所有错误，但是我失败了。希望我对迄今为止的任务和缺陷计划的描述不会混淆。定义哈希值和密钥并使用多个不同的文件

在我当前的目录中，我有一个可变数量的“.txt。”文件。（我可以有4,5,8或任意数量的文件，但我不认为我会得到更多的17个文件）。“.txt”文件的格式是相同的。有六列，用白色空格分隔。我只关心这些文件中的两列：第二列是珊瑚礁regionID（由字母和数字组成），第五列是p值。每个文件中的行数是未确定的。我需要做的是在所有.txt文件中查找所有常见regionID，并将这些常见区域打印到outfile中。但是，在印刷之前，我必须对它们进行分类。

以下是我的程序到目前为止，但我收到了错误消息，我已经包括在程序后。因此，我对变量的定义是主要问题。我非常感谢编写该程序的任何建议，并感谢您对像我这样的初学者的耐心。

更新：我已经按照建议声明了变量。查看我的程序后，出现两个语法错误。

syntax error at oreg.pl line 19, near "$hash{" 
    syntax error at oreg.pl line 23, near "}" 
    Execution of oreg.pl aborted due to compilation errors.

这里是编辑程序的摘录，其中包括所述错误的位置。

#!/user/bin/perl 
use strict; 
use warnings; 
# Trying to read files in @txtfiles for reading into hash 
foreach my $file (@txtfiles) { 
    open(FH,"<$file") or die "Can't open $file\n"; 
    while(chomp(my $line = <FH>)){ 
    $line =~ s/^\s+//;  
    my @IDp = split(/\s+/, $line); # removing whitespace 
    my $i = 0; 
    # trying to define values and keys in terms of array elements in IDp 
    my $value = my $hash{$IDp[$i][1]}; 
    $value .= "$IDp[$i][4]"; # confused here at format to append p-values 
    $i++;  
    }       
} 

close(FH);

这些都是过去的错误：

Global symbol "$file" requires explicit package name at oreg.pl line 13. 
Global symbol "$line" requires explicit package name at oreg.pl line 16. 
#[And many more just like that...] 
Execution of oreg.pl aborted due to compilation errors.

来源

2013-03-16 user2174373

你没有申报$file。

foreach my $file (@txtfiles) {

您没有申报$line。

while(chomp(my $line = <FH>)){

等

来源

2013-03-16 20:24:22 ikegami

感谢您的迅速回复。我很抱歉，但我对“声明”的含义感到困惑。 – user2174373 2013-03-16 20:37:09

'use strict'必须声明变量，例如与'我的$变量'之前使用它们。 – rjh 2013-03-16 21:06:43

@ user2174373，正确使用'my'，如我的答案所示。 – ikegami 2013-03-16 21:37:16

use strict; 
use warnings; 

my %region; 
foreach my $file (@txtfiles) { 
    open my $FH, "<", $file or die "Can't open $file \n"; 
    while (my $line = <$FH>) { 
    chomp($line); 
    my @values = split /\s+/, $line; 
    my $regionID = $values[1]; # 2nd column, per your notes 
    my $pvalue = $values[4]; # 5th column, per your notes 
    $region{$regionID} //= []; # Inits this value in the hash to an empty arrayref if undefined 
    push @{$region{$regionID}}, $pvalue; 
    }       
} 
# Now sort and print using %region as needed

在该代码的末尾，是散列，其中键是该区域ID和值是包含各种p-值阵列的引用。

下面的几个片断，可以帮助您完成后续步骤：

keys %regions会给你区域ID值的列表。

my @pvals = @{$regions{SomeRegionID}}会给你p值的列表SomeRegionID

$regions{SomeRegionID}->[0]会给你该区域的第一p值。

您可能想查看Data :: Printer或Data :: Dumper - 它们是CPAN模块，可让您轻松打印出数据结构，这可能有助于您了解代码中发生了什么。

来源

2013-03-22 15:51:43 RickF

定义哈希值和密钥并使用多个不同的文件

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