通过PHP使用R

我对R相对比较陌生，对Linux（Ubuntu）命令行也很新颖。我正在尝试在PHP中编写一个页面，其中包含一个我想在R中执行的命令，然后将结果传回以便能够与它们一起工作。我试过下面的代码的变化，但我只得到将R欢迎消息作为我的输出：通过PHP使用R

<?php 

$rQuery = "\"echo 3 + 1;\" | /usr/bin/R --no-save"; 
exec($rQuery, $output); 
print_r($output); 

?>

当我手动输入$ rQuery在命令行的结果是我所期待的：[1] 4.
我知道我必须在那里结束一些事情，但是我一直没能通过自己的搜索找到答案。

来源

2011-01-27 crix

几点：

你想--slave作为选项，这意味着--no-save并开启关闭问候;更多信息请参阅手册。
你真的想要的是杰夫·霍纳的优秀R-内的Apache，看到here for more。它也可以使用模板框架，如brew。最重要的是，Jeff现在为您提供了一个.deb软件包：在/etc/apt/sources.list中使用deb http://ppa.launchpad.net/jeffreyhorner/rapache/ubuntu lucid main。
如果你坚持要用php管道，请考虑littler脚本前端Jeff和我写的。它会启动速度比R.

来源

2011-01-27 16:27:37

1.谢谢！你不知道这多么令我讨厌。 2.这看起来非常有用，一旦我在这些东西中变得更好，我会研究它。这正是我所寻找的。感谢您的写作！如果其他人好奇，我可以通过使用以下命令获得准确的结果：“<？php $ rQuery =”r -e'cat（3 + 1）'“; system（$ rQuery）;？ >“ – crix 2011-01-27 17:24:37

快乐。 Littler（例如`/ usr/bin/r`）出于同样的原因使用该选项启动它的嵌入式R实例。 – 2011-01-27 17:27:14

无论用户apache运行的是什么，可能都没有相同的环境变量或权限，因为它们是手动从shell运行的。找出Apache运行的用户名，并确保它具有正确的权限和环境变量。

来源

2011-01-27 16:12:29 profitphp

谢谢，在R中尝试更复杂的命令时，我开始遇到这个问题。 – crix 2011-01-27 20:31:47

对于一些这个简单，你甚至不应该使用PHP，因为你可以用RApache，brew包和普通的HTML仅仅做到这一点（CSS/JS是可选的）。请阅读the RApache manual并参阅Jeroen Ooms的video tutorial。您还应该阅读brew手册。杰夫确实做得很好！

简而言之，你只需要设置apache2.conf或的.htaccess文件。您可以使用<FilesMatch>指令，而不是使用<Directory>或<Location>指令，以便将文件与regexpr匹配。下面是一个示例的.htaccess：

<FilesMatch "^.+\.rhtml$"> 
    SetHandler r-script 
    RHandler brew::brew 
</FilesMatch>

我使用特殊的文件扩展名.rhtml，我内<%和%>标签（见brew文档）混合有R语法HTML。我没有使用brew与PHP，因为brew与HTML做的伎俩。

不管怎样，你说，你想：

用PHP编写的网页包含命令我想中的R 执行，然后将结果传递回是能够一起工作他们

关于执行来自用户输入的命令......好吧......不要这样做！特别是不允许用户执行自定义命令，因为他们可以轻松地通过system或file.*命令并使您的系统瘫痪！您可以使用AppArmor的，但它仍然是一个很长的路下来...
专注于简单的HTML表单和使用POST，GET，COOKIES，FILES和服务器变量RApache提供，并然后操纵R脚本
关于“传递结果”的输入，您可以使用XML R包或rjson（我最喜欢的，我推荐它）。然后，您可以将R对象传递给toJSON函数，并使用JavaScript反序列化它。当然，只有当你的客户端是网页浏览器时才是这样，否则，如果你想将某些信息传递给嵌入式系统，你应该使用标准的XML-
这样简单的事情，你不需要需要PHP。无论如何，你应该联系的Jeroen，我知道他用了一些PHP在他Stockplot应用

如有其他问题，请RApache mailing list。

...和你好R-webdev世界！ =）

来源

2011-01-27 18:53:52 aL3xa

通过PHP使用R

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