“参数必须是可调用函数”当使用scipy.integrate.quad

我写了一些代码，使我能够从DICOM文件中获取数据并将数据分离为单独的FID信号。“参数必须是可调用函数”当使用scipy.integrate.quad

from pylab import * 
import dicom 
import numpy as np 
import scipy as sp 

plan=dicom.read_file("1.3.46.670589.11.38085.5.22.3.1.4792.2013050818105496124") 
all_points = array(plan.SpectroscopyData) 
cmplx_data = all_points[0::2] -1j*all_points[1::2] 
frames = int(plan.NumberOfFrames) 
fid_pts = len(cmplx_data)/frames 
del_t = plan.AcquisitionDuration/(frames * fid_pts) 

fid_list = [] 
for fidN in arange(frames): 
    offset = fidN * fid_pts 
    current_fid = cmplx_data[offset:offset+fid_pts] 
    fid_list.append(current_fid)

我现在想确定一些这个数据的话，应用傅里叶变换和移位我试着使用SciPy的的四功能，遇到了以下错误后：

spec = fftshift(fft(fid_list[0]))) 
sp.integrate.quad(spec, 660.0, 700.0) 



error          Traceback (most recent call last) 
/home/dominicc/Experiments/In Vitro/Glu, Cr/Phantom 1: 10mM Cr, 5mM Glu/WIP_SV_PRESS_ME_128TEs_5ms_spacing_1828/<ipython-input-107-17cb50e45927> in <module>() 
----> 1 sp.integrate.quad(fid, 660.0, 700.0) 

/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/integrate/quadpack.pyc in quad(func, a, b, args, full_output, epsabs, epsrel, limit, points, weight, wvar, wopts, maxp1, limlst) 
243  if type(args) != type(()): args = (args,) 
244  if (weight is None): 
--> 245   retval = _quad(func,a,b,args,full_output,epsabs,epsrel,limit,points) 
246  else: 
247   retval = _quad_weight(func,a,b,args,full_output,epsabs,epsrel,limlst,limit,maxp1,weight,wvar,wopts) 

/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/integrate/quadpack.pyc in _quad(func, a, b, args, full_output, epsabs, epsrel, limit, points) 
307  if points is None: 
308   if infbounds == 0: 
--> 309    return _quadpack._qagse(func,a,b,args,full_output,epsabs,epsrel,limit) 
310   else: 
311    return _quadpack._qagie(func,bound,infbounds,args,full_output,epsabs,epsrel,limit) 

error: First argument must be a callable function.

莫非

有人请建议一种方法来使这个对象可调用？阅读What is a "callable" in Python?后，我还是不太清楚。读完后，我试了

def fid(): 
    spec = fftshift(fft(fid_list[0])) 
    return spec

哪个返回了相同的错误。

任何帮助将不胜感激，谢谢。

来源

2013-05-09 docar

它不应该是一个需要参数的函数吗？还有什么可以整合？ – 2013-05-09 13:42:45

这个问题没有意义。你不能使用'scipy.integrate.quad'集成一个数组。它集成了一个*函数*，它接受一个参数（例如'sin（x）'）。使用类似'scipy.integrate.simps'的东西来集成一组函数值。 – talonmies 2013-05-09 13:44:11

由于您正在整合仅在网格上定义的函数（即数字数组），因此您需要使用“Integration, given fixed samples”中的一个例程。

事实上，第一个参数quad()must be a function，你可以调用（“可调用”）的东西。举例来说，你可以这样做：

>>> from scipy.integrate import quad 
>>> def f(x): 
...  return x**2 
... 
>>> quad(f, 0, 1) 
(0.33333333333333337, 3.700743415417189e-15)

这是可以做到的，而不是抽样f()：

>>> from scipy.integrate import simps 
>>> x_grid = numpy.linspace(0, 1, 101) # 101 numbers between 0 and 1 
>>> simps(x_grid**2, dx=x_grid[1]-x_grid[0]) # x_grid**2 is an *array*. dx=0.01 between x_grid values 
0.33333333333333337

你的情况就像是在第二个例子：你整合采样功能，因此很自然地使用一个或cumtrapz(),simps()或romb()。

来源

2013-05-09 13:50:50 EOL

“参数必须是可调用函数”当使用scipy.integrate.quad

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