This question说明我的问题正是，但我使用的app.config与ConfigurationManager自定义配置部分，因此该解决方案提出了有不适......如何使用ConfigurationManager通过ClickOnce更新来保持app.config？
基本上，我的问题是，当更新的ClickOnce应用程序，它会使用新的app.config安装到不同的目录中，从而删除所做的任何更改。我的应用程序使用app.config来保存应用程序设置，所以这非常糟糕......合并的更新会非常出色（与其他问题类似），但几乎所有的自动化功能都会很好。
或者我应该只使用一个设置位置为我的app.config文件，而不是尝试使用默认位置？
ClickOnce应该在更新之间保持用户设置，但是由于未知的原因（并且结果不好），我有一次或两次失败。我还没有尝试过自定义配置设置，但我对ClickOnce不覆盖设置的能力失去了信心。
我打算使用的方法是手动处理ClickOnce更新，而不是允许应用程序。检查更新并提示用户进行安装。我还有一些用户不接受更新，这是一个很难从中恢复的问题。通过手动处理更新，我希望能够在更新之前将用户设置读入内存，然后在更新完成后将其写回。有一个应用程序更新事件应该用于此目的。
也许这种方法也适用于你。
编辑补充参考资料：
谷歌搜索ApplicationDeployment也应该有所帮助。
如果可以，请使用Settings.settings（在项目中的属性下找到）来存储您的客户配置。
ClickOnce会自动合并您的用户设置，您不必担心任何事情。看看这样的更多说明：http://www.dotnetperls.com/settings-visual-studio
Whereabouts是这个ApplicationUpdated事件？我无法在对象浏览器中找到它...此外，这并没有帮助解决问题（虽然这是一个很好的功能，我从不喜欢ClickOnce对话框），但更新仍安装到新目录中，所以旧的app.config丢失 – 2009-06-17 14:14:42