使用rstudio/rmarkdown/knitr使用包texreg创建模型摘要表

我正在使用RStudio IDE（v 0.99.323）和，并试图通过knitr使用htmlreg生成模型表以生成MSWord输出。怀疑我错过了一些简单的事情。使用rstudio/rmarkdown/knitr使用包texreg创建模型摘要表

下面附加的rmarkdown块创建一个单独的文件'mytable.doc'与一个美丽的表。但是，当我在RStudio IDE中单击“编织单词”时，htmlreg（m）行会在MSWord文档中生成html表格代码。我究竟做错了什么？

非常感谢！ --Dale

```{r, results='asis'} 
library(MASS) 
library(texreg) 
data(menarche) 
m <- glm(cbind(Menarche, Total-Menarche) ~ Age, family=binomial(logit), data=menarche) 

htmlreg(m, file = "mytable.doc", caption="Age at Menarche", inline.css = TRUE, doctype = TRUE, html.tag = TRUE,            head.tag = TRUE, body.tag = TRUE, ci.force=TRUE, ci.test=NULL,bold=TRUE) 

htmlreg(m) 
```

来源

2015-03-13 user25494

您的目标是什么？在漂亮的markdown文档中有相同的漂亮的表格吗？ – vpipkt 2015-03-13 14:49:20

是的 - 我想在通过编织rmarkdown文件创建的html或word文档中嵌入相同的漂亮表格。 – user25494 2015-03-13 14:55:23

试试这个在您的块，仍然使用result='asis'：

library(pander) 
pander(m)

帽尖到http://www.r-statistics.com/2013/03/write-ms-word-document-using-r-with-as-little-overhead-as-possible/

他们还提出一个很好的方式，以澄清代码块，这样你可以只请致电print(m)，降价输出将从pander调用适当的功能。

来源

2015-03-13 15:08:12 vpipkt

感谢您的链接。添加pander（m）确实会产生很好的格式化输出。然而，texreg软件包非常灵活，并且能够生成将多个模型组合在一起的表格。 – user25494 2015-03-13 15:17:35

研究这个问题，我发现了一些能够对表格输出进行非常细致控制的方法，还有一些能够以所需格式自动执行“打印”。我的猜测是，您可能需要深入研究texreg如何生成html和Word输出。问题是如何正确地将这个集成到Rmarkdown - > markdown - > word工作流程中。 – vpipkt 2015-03-13 15:29:52

这是一个pandoc降价问题，或htmlreg未创建正确的缩进问题。我不完全明白，如果这是一个错误或隐蔽的，因为一个特点：

http://rmarkdown.rstudio.com/authoring_pandoc_markdown.html#raw-html

尝试一个简单的.md（不.rmd）文件，如下所示：

<h1>Works</h1> 

<table border="8"> 
    <tr> 
    <td>111</td> 
    <td>222</td> 
    <td>444</td> 
    </tr> 
</table> 

<h1>Not what you want</h1> 

<table border="8"> 
    <tr> 
    <td>111</td> 
    <td>222</td> 
    <td>444</td> 
    </tr> 
</table> 

<h1>Works too (not in screenshot)</h1> 

<table border="8"> 
    <tr><td>111</td><td>222</td><td>444</td></tr> 
</table>

output of raw html

来源

2015-03-13 15:55:48

您可以试试最新的texreg版本1.34.2（请参阅.tar.gz文件here或this后）？

根据RStudio开发者的说法，问题是他们切换到Pandoc的更新版本，该版本不再适用于缩进的HTML代码。更准确地说，它将使用四个空格缩进的文本解释为代码块，如Markdown符号中所示。有关他们的问题描述，请参阅here。

因此，在新的texreg版本中，在htmlreg函数中有一个名为indentation = ""的新参数。它默认关闭缩进。使用indentation = " "可恢复以前的行为。

编辑1：也请务必使用参数center = FALSE和star.symbol = "\\*"左侧定位和正确显示的意义明星。星号需要进行转义，因为他们另有解释为降价语法的一部分：

```{r, results = 'asis'} 
htmlreg(m, center = FALSE, star.symbol = "\\*") 
```{r}

对于PDF笔记本电脑（使用LaTeX的内部），使用texreg：

编辑2：也请阅读htmlreg的帮助页面，尤其是描述htmlreg参数的部分。它们包含一些关于如何使文档与Markdown相兼容的有用信息，Markdown使用RStudio，Pandoc和knitr来创建HTML文档。特别是，当您不打算创建完整的HTML文档时，请使用参数inline.css = TRUE，doctype = FALSE，html.tag = FALSE,head.tag = FALSE和body.tag = FALSE。

关于MS Word：您在您的问题下面的评论中提到您要创建HTML或Word文档。 htmlreg功能旨在创建HTML文件，而不是Word文件（如函数的名称所示）。但是，可以在MS Word中加载这些HTML文件，因为Word能够解释HTML代码。然而，据我所知（但我可能是错误的，因为我不知道knitr如何在内部创建Word文件），knitr创建二进制Word文档，并且直接在这些二进制Word文档中嵌入HTML代码是不可能的。但是，您可以尝试创建HTML笔记本，将它们保存到磁盘，然后在MS Word中打开它们。

来源

2015-03-13 18:01:05

关于为什么Word文档格式不正确的任何线索？ – user25494 2015-03-13 20:07:11

请参阅“编辑2”。另请注意，内部HTML浏览器以混乱的方式显示表格。使用其他浏览器（如Firefox或Chrome）正确显示表格。 – 2015-03-13 21:47:46

默认情况下，软件包作者已更新texreg以关闭缩进。

参见： http://rmarkdown.rstudio.com/authoring_migrating_from_v1.html#preserving-generated-html 通过更新包后： install.packages（ “texreg”，回购= “http://R-Forge.R-project.org”）

下面置于rmarkdown组块（.Rmd）文档现在产生一个美丽HTML表格，当我在RStudio中编织HTML。然而，'编织字'仍然不会产生预期的输出。

```{R，结果= 'ASIS'}

库（texreg）

htmlreg（米，字幕= “初潮年龄”，caption.above = TRUE，ci.force = TRUE，ci.test = NULL，bold = TRUE）

```

来源

2015-03-13 19:37:35 user25494

使用rstudio/rmarkdown/knitr使用包texreg创建模型摘要表

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