Networkx图形边缘绘制错误

我有以下代码可用于随机图表可以显示。但是，当我尝试使用其他图形类型时，在边缘绘制函数中出现错误。特别是边缘位置。Networkx图形边缘绘制错误

如果你对此有何评论

G = nw.random_geometric_graph(200, 0.125)

，并取消注释出现

G = nw.barabasi_albert_graph(200, 2)

错误消息。我是新来的python和NetworkX特别是任何帮助表示赞赏！

import matplotlib.pyplot as plt 
import networkx as nw 

G = nw.random_geometric_graph(200, 0.125) 

#G = nw.watts_strogatz_graph(200, 3, 0.125, seed=None) 
#G = nw.barabasi_albert_graph(200, 2) 

# position is stored as node attribute data for random_geometric_graph 
pos = nw.get_node_attributes(G, 'pos') 

# find node near center (0.5, 0.5) 
dmin = 1 
ncenter = 0 
for n in pos: 
    x, y = pos[n] 
    d = (x - 0.5) ** 2 + (y - 0.5) ** 2 
    if d < dmin: 
     ncenter = n 
     dmin = d 

# color by path length from node near center 
p = nw.single_source_shortest_path_length(G, ncenter) 

plt.figure(figsize=(8, 8)) 

nw.draw_networkx_edges(G, pos, nodelist=[ncenter], alpha=0.4) 
nw.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=list(p.keys()), node_size=80, node_color=list(p.values()), cmap=plt.cm.Reds_r) 

plt.xlim(-0.05, 1.05) 
plt.ylim(-0.05, 1.05) 
plt.axis('off') 
plt.savefig('random_geometric_graph.png') 
plt.show()

给出的错误信息是;

--------------------------------------------------------------------------- 
KeyError         Traceback (most recent call last) 
<ipython-input-11-> in <module>() 
    22 plt.figure(figsize=(8,8)) 
    23 
---> 24 nw.draw_networkx_edges(G, pos, nodelist=[ncenter], alpha=0.4) 
    25 nw.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=list(p.keys()), node_size=80, node_color=list(p.values()), cmap=plt.cm.Reds_r) 
    26 

/Users//anaconda/lib/python3.6/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py in draw_networkx_edges(G, pos, edgelist, width, edge_color, style, alpha, edge_cmap, edge_vmin, edge_vmax, ax, arrows, label, **kwds) 
    513 
    514  # set edge positions 
--> 515  edge_pos = numpy.asarray([(pos[e[0]], pos[e[1]]) for e in edgelist]) 
    516 
    517  if not cb.iterable(width): 

/Users//anaconda/lib/python3.6/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py in <listcomp>(.0) 
    513 
    514  # set edge positions 
--> 515  edge_pos = numpy.asarray([(pos[e[0]], pos[e[1]]) for e in edgelist]) 
    516 
    517  if not cb.iterable(width): 

KeyError: 0

来源

2017-04-20 AngusTheMan

如果您有错误，请将它们包含在帖子中并突出显示哪条特定行会导致错误 – EdChum

'pos = nw.get_node_attributes（G，'pos'）'适用于随机几何图形。对于其他人，它只是将'pos'设置为'{}'（空字典）。 – Joel

我不认为任何其他图形初始化方法除了random_geometric_graph设置节点位置自动（如本图中的连通性依赖于节点位置，是有意义的设置一个默认情况下）。如果你用watts_strogatz_graph检查你的例子，返回的字典实际上是空的（尽管它可能会抛出KeyError）。

您需要明确确定布局，例如，使用

pos = nw.spring_layout(G)

或任何其他布局算法。

来源

2017-04-20 13:28:36 Paul

你可以看到这个问题（从堆栈跟踪）是在这一行：

nw.draw_networkx_edges(G, pos, nodelist=[ncenter], alpha=0.4)

和错误是KeyError，这样的东西不能被发现。可能你需要在这里画edges，但你确实提供了nodelist。根据official docs，绘制edges的方法应该接受edgelist，而不是nodelist。

所以，你需要这样做：

nw.draw_networkx_edges(G, pos, edgelist=[SOME_EDGES_HERE], alpha=0.4)

请注意，这应该是边缘，而不是节点，所以你需要从中心节点找到他们。

来源

2017-04-20 19:42:36 VMAtm

Networkx图形边缘绘制错误

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