基因绘图仪安装错误

我在基因绘图仪（Bioconductor软件包）安装过程中。我在Linux Mint的，使用R 2.14 9.我觉得命名空间是负责这一点，但我不知道如何解决它...基因绘图仪安装错误

这里的错误：

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R") 
> biocLite("geneplotter") 
BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org' 
Using R version 2.14, BiocInstaller version 1.2.0. 
Installing package(s) 'geneplotter' 
Installing package(s) into ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14’ 
(as ‘lib’ is unspecified) 
essai de l'URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.9/bioc/src/contrib/geneplotter_1.31.4.tar.gz' 
Content type 'application/x-gzip' length 1387616 bytes (1.3 Mb) 
URL ouverte 
================================================== 
downloaded 1.3 Mb 

* installing *source* package ‘geneplotter’ ... 
** R 
** data 
** inst 
** preparing package for lazy loading 
** help 
*** installing help indices 
** building package indices ... 
*** tangling vignette sources ... 
    ‘byChroms.Rnw’ 
    ‘visualize.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded 
Error in namespaceExport(ns, exports) : 
    undefined exports: .__C__file, .__C__connection 
Erreur : le chargement a échoué 
Exécution arrêtée 
ERREUR : le chargement a échoué 
* removing ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/geneplotter’ 

The downloaded packages are in 
    ‘/tmp/RtmpO1aY1T/downloaded_packages’ 
Message d'avis : 
In install.packages(pkgs = pkgs, repos = repos, ...) : 
    installation of package ‘geneplotter’ had non-zero exit status

在此先感谢，

来源

2011-11-02 Nicolas Rosewick

联系包维护者???在2.14中命名空间处理方式发生了变化，很可能某些Bioconductor软件包还没有赶上... –

更新新版本的所有软件包，特别是rtracklayer;尝试'biocLite（字符（））' –

我更新了所有的包，但错误仍然存在。 –

寻找到这个更加紧密，geneplotterfailed to build的初始版本。所以你选择的版本是倒数第二个版本。您发现的问题昨天已更正，并在下一个构建周期内及时更正。 geneplotter应该在正确构建时正确安装，可能在中午PDT;寻找版本1.32.1。回想起来，不是一个SO问题; Bioconductor mailing list有一个post facility，不需要订阅。

来源

2011-11-02 14:53:31

感谢它现在的作品 –

基因绘图仪安装错误

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