2014-11-07 165 views
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在Linux Mint 17上运行R 3.1.2,当我尝试安装流行的软件包时,出现non-zero exit status。一个例子install.packages尝试的完整输出如下:在Linux Mint上无法安装R软件包17

> install.packages("plyr") 
Installing package into ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1’ 
(as ‘lib’ is unspecified) 
trying URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/plyr_1.8.1.tar.gz' 
Content type 'application/x-gzip' length 393233 bytes (384 Kb) 
opened URL 
================================================== 
downloaded 384 Kb 

* installing *source* package ‘plyr’ ... 
** package ‘plyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
** libs 
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include" -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o 
/bin/bash: g++: command not found 
make: *** [RcppExports.o] Error 127 
ERROR: compilation failed for package ‘plyr’ 
* removing ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/plyr’ 

The downloaded source packages are in 
    ‘/tmp/RtmpXe52Mz/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages("plyr") : 
    installation of package ‘plyr’ had non-zero exit status 

我得到本质上的其他包我尝试安装,如ggplot2vegan,尽管在许多情况下,它是更冗长,因为它试图和相同的消息未能安装依赖关系。

这似乎是一个有点常见的问题,但其他人似乎有outdatedsoftwareinsufficientmemory。我正在运行Mint和R的最新稳定版本,并且我有大量的RAM和交换文件,所以我不认为这些都会导致我的问题。

回答

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每错误消息

/bin/bash: g++: command not found 

你需要安装一个C++编译器。我将与其中的一个开始:

sudo apt-get install build-essentials  # key tools 

sudo apt-get install r-base-dev    # many development tools for R 

或课程

sudo apt-get install r-cran-rcpp    # to not install from source 

的虽然RCPP你可能比你需要的一个更老。

对于基于Debian的系统的用户,有一个列表r-sig-debian

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非常感谢将来的读者,'sudo apt-get install r-base-dev'为我打开了诀窍。 – Joe 2014-11-11 03:14:06

+1

伟大的答案@DirkEddelbuettel! – Quantopik 2015-03-16 22:58:33

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在我的情况下,我正在运行一个相当新的Mint 18安装,并且我错过了某些软件包。根据R中的错误消息,我试图安装“readr”,但是因为我缺少一个底层软件包“libcurl4-openssl-dev”,所以无法安装。我apt-got了,然后readr安装没有错误,现在我的RStudio包按预期加载。