使用二进制掩码获取感兴趣的区域itk

Question

我对ITK来说很新，因此几乎没有使用它的经验。 我的问题是：

我有两个nifti图像：一个医学图像和一个代表感兴趣体积的二进制图像。 我想从医学图像中只提取感兴趣区域的区域。我想将该区域的强度值存储在多维数组中。 直到现在我读取图像和掩码并将其值存储在多维数组中。我现在可以逐个像素地比较这些值，但我希望可能有更简单的方法？

Answer 1

这听起来像是Region of interest filter的工作。首先，您需要确定面罩周围的“边界区域”。你应该使用iterator。如果您在不使用中间Update()调用和streaming构建流水线（reader-> regionOfInterest-> writer）时，使用某些图像格式（例如元图像），则不需要从磁盘完全读取强度图像。您可能也有兴趣LabelGeometryImageFilter。