2014-10-10 86 views
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G。 。 PASS VRT = 1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
G。 。 PASS VRT = 1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
C。 。 PASS VRT = 1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0awk + ​​gsub特殊字符

我有一个如上所示的文件,我试图用列1中的文本替换0/0。

awk -F'\t' '{ gsub("0/0", $1/$1);}1' OFS="\t" file.txt 

输出应该是这样的:

G  .  .  PASS VRT=1 GT  G/G  G/G  G/G  G/G  G/G  G/G  
G  .  .  PASS VRT=1 GT  G/G  G/G  G/G  G/G  G/G  G/G  
C  .  .  PASS VRT=1 GT  C/C  C/C  C/C  C/C  C/C  C/C 

它抛出错误 “AWK:被零除”。看起来我不符合特殊字符。有人可以帮忙吗?

回答

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你的意思是:

awk -F'\t' 'gsub("0/0", $1"/"$1)+1' OFS="\t" file.txt 
+0

谢谢!我错过了代码中的“/” – chas 2014-10-10 14:07:20