2010-02-26 96 views
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我有一个情节(示例代码粘贴在下面),我试图通过自己的标签添加系列信息。我不想绘制“p1s1”“p1s2”“p3s4”,我想要“处理1”“处理2”“处理3”。我已经使用关卡(series_id)来获取唯一的系列名称,并使用查找表来获取描述。 (我认为这让他们按照他们绘制的顺序?),并且我在一个名为treatment_descriptions的矢量中有这些描述。如何将自定义系列标签添加到R的ggplot中的图例?

从文档我认为我应该在这里使用一个规模,但我不知道哪一个,或者如何去做。类似于:scale_something(name =“Treatment Descriptions”,breaks = NULL,labels = treatment_descriptions,formatter = NULL)?但是这应该去哪里?

library(ggplot2) 

# Create a long data.frame to store data... 
growth_series = data.frame ("read_day" = c(0, 3, 9, 0, 3, 9, 0, 2, 8), 
"series_id" = c("p1s1", "p1s1", "p1s1", "p1s2", "p1s2", "p1s2", "p3s4", "p3s4", "p3s4"), 
"mean_od" = c(0.6, 0.9, 1.3, 0.3, 0.6, 1.0, 0.2, 0.5, 1.2), 
"sd_od" = c(0.1, 0.2, 0.2, 0.1, 0.1, 0.3, 0.04, 0.1, 0.3), 
"n_in_stat" = c(8, 8, 8, 8, 7, 5, 8, 7, 2) 
) 

> # Now gives us some example long form data... 
> > growth_series 
> read_day series_id mean_od sd_od  n_in_stat 
> 1  p1s1  0.6  0.10   8 2  
> 3  p1s1  0.9  0.20   8 3  
> 9  p1s1  1.3  0.20   8 4  
> 0  p1s2  0.3  0.10   8 5  
> 3  p1s2  0.6  0.10   7 6  
> 9  p1s2  1.0  0.30   5 7  
> 0  p3s4  0.2  0.04   8 8  
> 2  p3s4  0.5  0.10   7 9  
> 8  p3s4  1.2  0.30   2 2 

# Plot using ggplot... 
ggplot(data = growth_series, aes(x = read_day, y = mean_od, group = series_id, color = series_id)) + 
geom_line(size = 1.5) + 
geom_point(aes(size = n_in_stat)) + 
geom_errorbar(aes(ymin = mean_od - sd_od, ymax = mean_od + sd_od), size = 1, width = 0.3) + 
xlab("Days") + ylab("Log (O.D. 730 nm)") + 
scale_y_log2() + 
scale_colour_hue('my legend', breaks = levels(growth_series$series_id), labels=c('t1', 't2', 't3')) 

回答

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也许你可以重新标记你的因素?

growth_series$series_id <- factor(
    growth_series$series_id, 
    labels=c('treatment 1', 't2', 't3')) 

或者,如果你还在寻找scale_something,它应该是scale_colour_hue()

... + scale_colour_hue('my legend', 
    breaks = levels(growth_series$series_id), 
    labels=c('t1', 't2', 't3')) 
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谢谢,第一个建议的工作,第二个也没有,我会保持开放的问题,现在,因为我认为应该有更好的方法来做到这一点。我的描述很长,所以让他们在桌面上看起来非常丑陋,但我想我不需要把它们放到桌子上,直到我进行绘图之前,所以这不是什么大问题。干杯,约翰 – John 2010-02-26 16:49:58

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第二个有什么问题?顺便说一句,“...”代表你的组ggplot()+ geom_line + .. + scale_y_log2 – xiechao 2010-02-26 17:04:16

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当然,我尝试过,但是我得到一个语法错误,它是否适合你? – John 2010-02-26 20:35:28

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