转置水平数据并保存它们

我有一个简单的代码，其想法是打开一个六列文件，选择一列并保存。我面临的问题是我不断获得水平排列的数据。当我试图调换他们，我得到了一个更奇怪的输出，看起来像转置水平数据并保存它们

[number1, number2, number3, ..., number4, number5, number6]

虽然有一列中的一个万点。我怎样才能解决这个问题？

import numpy as np 

filename = "C:\\Users\\blablabla.dat" 
col_sep = "\t" 

col_1 = [] 

with open(filename,'r') as f: 
    for line in f: 
     if line[0] != "#": 
      linedata = [float(line.split(col_sep)[i]) for i in range(len(line.split(col_sep)))] 
      col_1.append(linedata[4]) 

tr = np.transpose(col_1) 

s = str(tr) 
c = open("C:\\Users\\blablabla1.dat", "w") 
c.write(s) 
c.close()

来源

2017-07-15 DenGor

因此，您试图从文件中提取一列并将其保存到另一个文件？

这应做到：

filename = "C:\\Users\\blablabla.dat" 
col_sep = "\t" 

col_1 = [] 
with open(filename, 'r') as f: 
    for line in f: 
     if line[0] != "#": 
      col_1.append(float(line.split(col_sep)[4])) 

with open("C:\\Users\\blablabla1.dat", "w") as f: 
    for val in col_1: 
     f.write("%f\n" % val)

的list在你的程序中调用col_1不附带任何方向，它既不水平，也不是垂直的;它只是一个值的列表。您正在使用特定列中的值填充它，逐行读取文件并手动解析。要将其保存为列，您必须以相同的方式迭代它，并且每行写入一个值。

此外，只是为了揭秘发生了什么; np.transpose对您的一维数据没有任何影响，只是将np.array（矢量）与list中的数据一起返回。 str，返回的是您写入输出文件的array的可读字符串表示形式。

来源

2017-07-15 15:20:25 randomir

谢谢，原来如此！我看到你的方法很简单直接。你能解释为什么转座不起作用吗？ – DenGor

'转置'开关轴;如果只有一个轴，则切换它不执行任何操作。 – hpaulj

代替使用np.transpose（这是一个无操作用于1D数据），你可以简单地将其转换为一个阵列中后添加维度的：

tr = np.array(col_1)[:, None] # instead of "tr = np.transpose(col_1)"

例如：

>>> np.array([1,2,3,4,5,6])[:, None] 
array([[1], 
     [2], 
     [3], 
     [4], 
     [5], 
     [6]])

有有几种其他方法可以改善你的代码，但这种改变应该能解决这个问题。 :)

例如numpy.loadtxt可以用来以更直接的方式来提取柱：

# to extract the fifth column of a csv file: 
tr = np.loadtxt(filename, delimiter=col_sep, comments='#')[:, 4][:, None]

来源

2017-07-15 15:34:41 MSeifert

谢谢，这个作品也是！该列表现在可以转置。 – DenGor

@DenGor没问题。请不要忘记[upvote]（https://meta.stackexchange.com/questions/173399/how-to-upvote-on-stack-overflow）所有有用的答案。 – MSeifert

file.write('\n'.join([str(_) for _ in col_1]) + '\n')可以为你工作。

顺便说一下numpy.ndarray对象不能直接写入文件，而是尝试numpy.savetxt()。

来源

2017-07-15 15:45:58 Nriuam

使用numpy.loadtxt()读取整个输入表为numpy数组，然后在不同的输出文件中使用numpy.savetxt栏目保存单个列，例如：

import numpy as np 
data = np.loadtxt(filename).T 
output_filenames = ['file1.txt', 'file2.txt', 'file3.txt', ...] # add 3 more names 
for col, fn in zip(data, output_filenames): 
    np.savetxt(fn, col)

来源

2017-07-15 15:54:13

尽管此代码可能会回答这个问题，但提供关于此代码为何和/或如何回答问题的其他上下文可提高其长期价值。 –

你不应该删除它，你应该编辑它来添加一些解释。 –

@DonaldDuck我认为代码很简单，不言而喻。但是，如果您无法理解其中的任何部分，请在此发布具体问题，我会尽力解决它。 –

转置水平数据并保存它们

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