的Linux的Makefile：未定义的引用 'gzbuffer'（其中LIB = -lz）

我试着按以下步骤安装程序（vcftools），为此，Makefile中写道：的Linux的Makefile：未定义的引用 'gzbuffer'（其中LIB = -lz）

# Make file for vcftools 
# Author: Adam Auton 
# ($Revision: 230 $) 

# Compiler 
CPP = g++ 
# Output executable 
EXECUTABLE = vcftools 
# Flag used to turn on compilation of PCA routines 
ifndef VCFTOOLS_PCA 
     VCFTOOLS_PCA = 0 
endif 
# Compiler flags 
CPPFLAGS = -O2 -Wall -Wextra -D_FILE_OFFSET_BITS=64 
#CPPFLAGS = -g 
# Included libraries (zlib) 
#LIB = -lz 
LIB = -lz -I/usr/local/include/ -L/usr/local/lib/ 


OBJS = vcftools.o vcf_file.o vcf_entry.o \ 
       vcf_entry_getters.o vcf_entry_setters.o \ 
       vcf_file_filters.o vcf_file_output.o \ 
       vcf_file_format_convert.o \ 
       vcf_file_diff.o parameters.o \ 
       vcf_file_index.o \ 
       output_log.o

我一直没能够得到这个Makefile正确运行，而是吃出一条错误：

vcf_file.cpp:(.text+0xe72): undefined reference to `gzbuffer' 
collect2: ld returned 1 exit status 
make[1]: *** [vcftools] Error 1 
make[1]: Leaving directory `/home/Public/Packages/vcftools_0.1.10/cpp' 
/bin/sh: 2: cd: can't cd to perl 
make: *** [install] Error 2

我认为问题的一部分是，有涉及到我的zlib的安装路径错误。我试图改变-I和-L路径来匹配我的zlib安装，但没有任何运气（有很多文件夹似乎包含zlib文件）。

此外，通过搜索与此程序相关的其他论坛（here），似乎我可能需要zlib1g-dev。的zlib1g-dev的是我的电脑上（它显示在我的Ubuntu软件中心），但显示不出来，当我进入：

[email protected]:/home/Public/Packages/vcftools_0.1.10/cpp# whereis zlib1g-dev 
zlib1g-dev: 
[email protected]:/home/Public/Packages/vcftools_0.1.10/cpp# which zlib1g-dev

我已经考虑删除并重新安装zlib的，但它看起来像有几个程序依赖于它。当试图运行安装或删除，我得到以下信息：

命令和apt-get安装的zlib-devel的

Reading package lists... Done 
Building dependency tree  
Reading state information... Done 
E: Unable to locate package zlib-devel

我不知道问题出在zlib的安装在我的电脑，安装中的错误，或其他完全在我头上的东西。任何建议将不胜感激。谢谢。

来源

2013-01-18 jme6f4

FTR gzbuffer（）是添加到zlib 1.2.3.5（2010年1月8日） – marcin

在我的系统（Ubuntu 12.04.3 LTS）上，这是一个lib位置问题。
确保已安装zlib1g-dev。
在vcftools_whatever/CPP/Makefile文件，更改

LIB = -lz

到

LIB = -L/usr/local/lib/ -lz

来源

2013-12-15 00:48:07 travc

有一个在obuntu在这方面，在特定库的声明必须的声明后出现的错误图书馆路径。

在Makefile的-lz后，才能被放置-L/usr/local/lib/

我建议改变LIB声明下面的一个 - 这应该可以解决问题

LIB = -I/usr/local/include/ -L/usr/local/lib/ -lz

来源

2016-09-01 08:05:35 Haggai

的Linux的Makefile：未定义的引用 'gzbuffer'（其中LIB = -lz）

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