我正在运行Ubuntu 16.04 [现在17.04:请参阅下面以粗体显示]和R 3.4.1。今天早上我安装了后者,所以我认为这是最新版本。我想安装Tidyverse,我在Windows下花了很多快乐时光。但是当我做install.packages("tidyverse")
时,我收到有关无法识别的gcc命令行选项的错误。这些在安装命中colorspace和munsell软件包时开始。我会在这篇文章的末尾展示一个例子,仅供参考。如何在Ubuntu 16.04和17.04上安装Tidyverse
我还没有发现任何人在Ubuntu 16.04上遇到过这个问题。但是,来自具有类似问题的人的帖子表明,我的gcc可能是一个太旧的版本,无法识别选项-fstack-protector-strong和-Wdate-time。我已经想到了
可能的变通:
1),希望这些人有一个合适的GCC更新的Ubuntu 16.10至17.04或。但是,我在这里遇到了缺乏Ubuntu专业知识的情况:尤其是,我必须升级两次,一次升至16.10,然后再升至17.04。我甚至无法将系统升级到16.10:在https://wiki.ubuntu.com/YakketyYak/ReleaseNotes“从Ubuntu 16.04 LTS升级”中推荐的步骤,在尝试升级时找不到升级。另外,我不确定这两个Ubuntus是否都有合适的gcc。
在第二天添加:虽然我试图通过以下https://wiki.ubuntu.com/YakketyYak/ReleaseNotes升级Ubuntu,但是他们昨天没有做任何事情,他们今天确实工作。也许是缓存问题?所以我现在有Ubuntu 17.04。但是,在尝试安装Tidyverse时,我仍然遇到同样的错误。
2)找到不需要那些编译器选项的旧版Tidyverse。
3)升级我的Ubuntu的gcc。但我不知道是否会在我的机器上烧毁其他软件,而这些软件需要较旧的gcc。
4)为Tidyverse安装一个新的gcc,并以某种方式使用路径欺骗安装程序调用它,也许通过遵循https://askubuntu.com/questions/466651/how-do-i-use-the-latest-gcc-on-ubuntu中的建议。但这听起来很危险。
5)废弃Ubuntu,并做所有我的工作在Windows上。我知道人们嘲笑“Micro $ oft”,但至少在Windows中,我不会浪费一个早上的Linux arcana,并且可以完成我的工作,这就是R.这种感觉太像太神奇了,他们的咒语在https://people.dsv.su.se/~jpalme/s1/hoare.pdf ,“软件设计:一个寓言”。只是说...
任何人谁已经实际上已经与这些版本的R和Ubuntu做到这一点的建议?
这里有一个安装失败:
`> install.packages("munsell") Installing package into ‘/home/popx/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’ (as ‘lib’ is unspecified) also installing the dependency ‘colorspace’ trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/colorspace_1.3-2.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 293433 bytes (286 KB) ================================================== downloaded 286 KB trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/munsell_0.4.3.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 97244 bytes (94 KB) ================================================== downloaded 94 KB * installing *source* package ‘colorspace’ ... ** package ‘colorspace’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c colorspace.c -o colorspace.o gcc: error: unrecognized command line option '-fstack-protector-strong' gcc: error: unrecognized command line option '-Wdate-time' /usr/lib/R/etc/Makeconf:159: recipe for target 'colorspace.o' failed make: *** [colorspace.o] Error 1 ERROR: compilation failed for package ‘colorspace’ * removing ‘/home/popx/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/colorspace’ Warning in install.packages : installation of package ‘colorspace’ had non-zero exit status ERROR: dependency ‘colorspace’ is not available for package ‘munsell’ * removing ‘/home/popx/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/munsell’ Warning in install.packages : installation of package ‘munsell’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpQ8FW70/downloaded_packages’ Warning message: R graphics engine version 12 is not supported by this version of RStudio. The Plots tab will be disabled until a newer version of RStudio is installed.