你怎么grep一个文件，并获得下一个选项卡的两行？

我可以从文本文件中使用以下shell命令来grep包含模式“基因”和下两个连续行的行。你怎么grep一个文件，并获得下一个选项卡的两行？

grep -A 2 ' gene' file

输出：

 gene   1..1515 
        /locus_tag="MSMEI_RS00005" 
        /old_locus_tag="MSMEI_0001" 
    gene   2109..3302 
        /locus_tag="MSMEI_RS00010" 
        /old_locus_tag="MSMEI_0003"

现在我的目标是用标签打印连续线，如

gene   1..1515   /locus_tag="MSMEI_RS00005" /old_locus_tag="MSMEI_0003" 
gene   2109..3302  /locus_tag="MSMEI_RS00010" /old_locus_tag="MSMEI_0003"

我怎么做这与外壳相同的grep命令？

来源

2017-04-20 user1427429

什么是您的操作系统？ –

使用Ubuntu – user1427429

如果内容中有4列没有列内容空间，如示例中所示，请尝试将输出管道输出到'xargs -n4 |列-t“ – Sundeep

随着SED：

sed -nEe '/^  gene/{N;N;s/\n */\t/g;p}' file

/ gene/在匹配该模式的行上工作，然后我们读取两个N分机行，s ubstitute换行符和空格，然后选择制表符，然后p rint。

来源

2017-04-20 11:01:11 ilkkachu

你不需要grep它，Awk可以利用其getline()函数来获得未来两个后续行做操作，

awk 'BEGIN{OFS="\t"}/gene/{getline n1; getline n2; print $0, n1,n2}' file

（或）如果你是不屑与前导空格，带他们使用gsub()功能，

awk 'BEGIN{OFS="\t"}/gene/{gsub(/^[[:space:]]+/,"",$0); getline n1; getline n2; print $0, n1,n2}' file

来源

2017-04-20 10:56:21 Inian

你怎么grep一个文件，并获得下一个选项卡的两行？

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