将两个单通道TIFF堆栈结合到单个多通道堆栈

Question

我有两个tiff堆栈，其延时数据对应于显微镜实验中获取的不同通道。我想将它们合并成一个有两个通道的单个堆栈。两个堆栈都是16位灰度。

当我使用：

convert stack1.tiff stack2.tiff stack_merged.tiff 

我得到一个单一的，而是连结文件有两个堆栈此起彼伏。

链接到file 1和file 2。

Answer 1

我想你需要的东西是这样的：

#!/bin/bash 

# Get index of last frame in TIFF image 
last=$(convert stack1.tif -print "%[fx:n-1]" null:) 

# Combine all frames 
for i in `seq 0 $last`; do 
    convert stack1.tif[$i] stack2.tif[$i] -combine miff:- 
done | convert miff:- -compress lzw result.tif