删除特定字符的行而不是部分相同的字符

我处理一些qPCR的结果，我想删除的假阳性结果在R的原始数据如下：删除特定字符的行而不是部分相同的字符

Gene Sample Ct 
aacC 1 27.57863 
aacC1 1 23.64810 
aacC2 1 28.65250 
aacC4 1 34.21550 
tetA 1 25.37649 
tet(34) 1 29.39106 
aacC 2 33.89373 
aacC1 2 30.94777 
aacC2 2 35.08097 
aacC4 2 24.55223 
tetA 2 11.88988 
tet(34) 2 18.39641 
aacC 3 30.64538 
aacC1 3 27.13225 
aacC2 3 11.72730 
aacC4 3 23.60715 
tetA 3 15.78128 
tet(34) 3 12.49784

我想去除基因“aacC”和“tet（34）”。我期望的结果是：

Gene Sample Ct 
aacC1 1 23.64810 
aacC2 1 28.65250 
aacC4 1 34.21550 
tetA 1 25.37649 
aacC1 2 30.94777 
aacC2 2 35.08097 
aacC4 2 24.55223 
tetA 2 11.88988 
aacC1 3 27.13225 
aacC2 3 11.72730 
aacC4 3 23.60715 
tetA 3 15.78128

我使用的代码如下：

false_signal<-c("aacC", "tet(34)") 
ct<-ct[!grepl(paste(false_signal, collapse="|"), ct$Gene),]

然而，我发现含有 “AACC” 除去所有基因，和TET（34）被留。结果是：

Gene Sample Ct 
tetA 1 25.37649 
tet(34) 1 29.39106 
tetA 2 11.88988 
tet(34) 2 18.39641 
tetA 3 15.78128 
tet(34) 3 12.49784

你能帮我解码吗？我只想删除“aacC”和“tet（34）”，但不是“aacC1”，“aacC2”，“aacC4”。我想可能是我在使用“grep”函数时错过的东西。

来源

2017-08-31 Guagua

也许使用具有精确匹配“％的％”？ 'ct_clean < - ct [！ct $ Gene％in％c（“aacC”，“tet（34）”），]' – zx8754

或非常简单：ct_clean < - ct [ct $ Gene！=“aacC”＆ct $ Gene！=“tet（34）”，] – KoenV

请勿使用正则表达式进行精确匹配。 –

-1

假设你的数据在一个名为qPCR的数据帧，我会用subset1 <- qPCR[ which(qPCR$Gene != 'aacC' & qPCR$Gene != 'tet(34)'), ]

来源

2017-08-31 07:30:19 Leila

谢谢莱拉。由于我有另外40个引物可以从结果中删除，我想用一个简单的代码来实现这个，你有什么建议吗？ – Guagua

糟糕...你看过zx8754标记的重复问题吗？ – Leila

删除特定字符的行而不是部分相同的字符

回答

相关问题